авторефераты диссертаций БЕСПЛАТНАЯ  БИБЛИОТЕКА

АВТОРЕФЕРАТЫ КАНДИДАТСКИХ, ДОКТОРСКИХ ДИССЕРТАЦИЙ

<< ГЛАВНАЯ
АГРОИНЖЕНЕРИЯ
АСТРОНОМИЯ
БЕЗОПАСНОСТЬ
БИОЛОГИЯ
ЗЕМЛЯ
ИНФОРМАТИКА
ИСКУССТВОВЕДЕНИЕ
ИСТОРИЯ
КУЛЬТУРОЛОГИЯ
МАШИНОСТРОЕНИЕ
МЕДИЦИНА
МЕТАЛЛУРГИЯ
МЕХАНИКА
ПЕДАГОГИКА
ПОЛИТИКА
ПРИБОРОСТРОЕНИЕ
ПРОДОВОЛЬСТВИЕ
ПСИХОЛОГИЯ
РАДИОТЕХНИКА
СЕЛЬСКОЕ ХОЗЯЙСТВО
СОЦИОЛОГИЯ
СТРОИТЕЛЬСТВО
ТЕХНИЧЕСКИЕ НАУКИ
ТРАНСПОРТ
ФАРМАЦЕВТИКА
ФИЗИКА
ФИЗИОЛОГИЯ
ФИЛОЛОГИЯ
ФИЛОСОФИЯ
ХИМИЯ
ЭКОНОМИКА
ЭЛЕКТРОТЕХНИКА
ЭНЕРГЕТИКА
ЮРИСПРУДЕНЦИЯ
ЯЗЫКОЗНАНИЕ
РАЗНОЕ
КОНТАКТЫ

Изучение аутосомного днк полиморфизма в популяциях центральной россии

На правах рукописи

ВАЩИЛИН ВЛАДИМИР СЕРГЕЕВИЧ ИЗУЧЕНИЕ АУТОСОМНОГО ДНК ПОЛИМОРФИЗМА В ПОПУЛЯЦИЯХ ЦЕНТРАЛЬНОЙ РОССИИ 03.00.15 генетика

АВТОРЕФЕРАТ

диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук

Москва – 2009 2

Работа выполнена на кафедре медико-биологических дисциплин медицинского факультета Государственного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Белгородский государственный университет».

Научный консультант:

доктор медицинских наук, профессор Чурносов Михаил Иванович

Официальные оппоненты:

доктор медицинских наук, профессор Асанов Алий Юрьевич кандидат биологических наук Азова Мадина Мухамедовна

Ведущая организация:

ГОУ ВПО Московский государственный медико-стоматологический университет

Защита диссертации состоится « 2009 года в часов на » заседании Диссертационного совета Д 212.203.05, при ГОУ ВПО «Российский университет дружбы народов» по адресу: 117198, г.

Москва, ул. Миклухо-Маклая, д.

С диссертацией можно ознакомиться в Научной библиотеке ГОУ ВПО «Российский университет дружбы народов» по адресу: 117198, г.

Москва, ул. Миклухо-Маклая, д.

Автореферат разослан « 2009 года »

Ученый секретарь диссертационного совета кандидат биологических наук, доцент О.Б. Гигани

ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ

Актуальность проблемы.

Изучение структуры генофонда различных групп народонаселения, решение вопросов микроэволюции популяций человека, их происхождения, родства, исторического развития и взаимодействия со средой является одной из важнейших задач современной антропогенетики [Рычков, 2000, Гинтер, 2003, Алтухов, 2004].

В данный момент происходит смена инструментариев изучения генофонда: уже сейчас генетическая изменчивость популяций анализируется главным образом на уровне полиморфизма ДНК [Балановская и др., 2006]. С помощью полиморфных маркеров ДНК описаны различные популяции: Европы [Nagai et al., 1994, Budowle et al., 1995, Ciesielka, 1996, Collier et al., 1996, Vieyra et al., 2003], Азии [Nakatom et al., 1995, Martinson et al., 1997, Shinohara et al., 2004], Америки [Hutz et al., 1997, Hooper et al., 1999, Mitchell et al., 2000], Африки [Hixon et al, 1993, Budowle et al., 1995].

Достаточно интенсивно исследуется аутосомный ДНК полиморфизм и среди разных этнотерриториальных групп России:

народы Волго-Уральского региона [Хуснутдинова и др., 1995, 1999, 2003, Викторова и др., 2000, 2002], Сибири [Пузырев и др., 2004, Степанов и др., 1999, 2002], Северного Кавказа [Почешкова и др., 2007, 2008] и других регионов России [Баранов, 1993, 2004, Спицын и др., 1997, Лимборская и др., 1999, 2002, Чистяков и др., 2000, Балановская и др., 2006].

Однако, несмотря на значительный массив данных по аутосомным ДНК маркерам среди различных популяций России, их изученность для русского народа остается явно не достаточной. В литературе имеются данные лишь о небольшом количестве русских популяций (около 10), расположенных в пределах исконного ареала русского народа, изученных с использованием аутосомных ДНК маркеров [Лимборская и др., 2002, Чистяков и др., 2000, Асеев и др., 1997, Спиридонова и др., 2002]. Наряду с этим, следует отметить, что потенциальный набор ДНК маркеров весьма велик, и вследствие этого сложилась ситуация, когда провести сравнительный анализ разных генофондов по аутосомным ДНК маркерам довольно таки сложно – каждый изучен по собственному набору маркеров, вследствие несогласованного подхода в изучении русского генофонда различными генетическими лабораториями [Балановская, 2006].

Поэтому одной из важных задач современной генетики народонаселения России является популяционно-генетическое исследование русского народа с использованием единого широкого спектра аутосомных ДНК полиморфизмов.

Цель работы.

Изучить генофонд коренного русского населения Центральной России и его место среди восточнославянского и евразийского генофондов.

Задачи исследования.

1. Дать характеристику генофонда коренного русского населения Центральной России по данным о распределении частот 56 аллелей аутосомных ДНК маркеров.

2. Оценить степень генетической дифференциации русских популяций Центральной России.

3. Изучить генетические соотношения между различными популяциями Центральной России.

4. Определить место генофонда населения Центральной России среди популяций восточных славян, а также популяций Евразии.

Научная новизна.

Изучены особенности структуры генофонда населения Центральной России. Получены данные о распределении 56 аллелей аутосомных ДНК локусов. Оценена генетическая изменчивость шести территориальных групп русских Центральной России.

Установлены особенности генетической подразделенности популяций Центральной России. Выявлена их дифференциация на два кластера – «юго-восточный» и «северо-западный». Определено положение генофонда населения Центральной России в системе восточнославянского генофонда. В системе евразийского генофонда популяции Центральной России генетически близки к населению Восточной Европы и имеют наибольшие генетические расстояния от популяций азиатского региона.

Научно-практическая значимость работы.

Охарактеризована генетическая структура коренного русского населения Центральной России по единому большому спектру диаллельных и мультиаллельных аутосомных ДНК маркеров.

Установлено наличие подразделенности между территориальными группами русского населения Центральной России.

Проведена оценка генетической дифференциации коренного русского населения Центральной России. Установлены особенности генетических соотношений населения Центральной России с восточнославянскими популяциями. Определено положение популяций Центральной России в системе евразийского генофонда.

Полученные данные послужат основой для генетического и эколо генетического мониторинга населения Центральной России. Результаты исследования могут представлять интерес для этнографов, антропологов, демографов и лингвистов, а также послужат важным дополнением в исследованиях по истории формирования населения Центральной России. Результаты работы используются в учебном процессе в ГОУ ВПО Белгородском государственном университете и в ГОУ ВПО Курском государственном медицинском университете.

Положения, выносимые на защиту.

1. Генофонд русского населения Центральной России имеет четко выраженные западно-евразийские характеристики.

2. Популяции Центральной России дифференцируются на два кластера – «юго-восточный» и «северо-западный».

3. Население Центральной России генетически близко к «среднерусской» популяции, и удалено от украинцев и белорусов.

4. Популяции Центральной России имеют наименьшие генетические расстояния с популяциями Восточной Европы и максимальные генетические дистанции с народами азиатского региона.

Апробация работы.

Основные результаты диссертации доложены и обсуждены на:

Годичной научной конференции сотрудников Белгородского госуниверситета (Белгород 2005, 2006, 2007, 2008), Юбилейной научной конференции КГМУ и сессии Центрально-Черноземного научного центра РАМН, посвященной 70-летию КГМУ (Курск, 2005), Пятом съезде Российского общества медицинских генетиков (Уфа, 2005), Российской научной конференции с международным участием «Медико–биологические аспекты мультифакториальной патологии» (Курск, 2006), 71-й научной конференции КГМУ и сессии Центрально Черноземного научного центра РАМН (Курск, 2006), Международной конференции «Генетика в России и мире», посвященной 40-летию Института общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН (Москва, 2006), IX Международной научно-практической экологической конференции «Современные проблемы популяционной экологии» (Белгород, 2006), 72-й научной конференции КГМУ и научной сессии Центрально Черноземного научного центра РАМН (Курск, 2007), 7-м конгрессе этнографов и антропологов России (Саранск, 2007) III Международной Пироговской научной медицинской конференции (Москва, 2008).

Публикации.

По теме диссертации опубликовано 14 работ, из них 6 в журналах из списка ВАК.

Структура и объем диссертации.

Диссертация изложена на 178 страницах и состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов исследования, собственных результатов, заключения, выводов, списка литературы.

Работа иллюстрирована 21 таблицой и 24 рисунками. Приложение изложено на 14 страницах. Библиографический указатель содержит наименований, из них 81 зарубежных авторов.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ Проведено изучение генетической структуры популяций Центральной России по 8 аутосомным ДНК локусам (инсерционно делеционные полиморфизмы генов АСЕ и CCR5, VNTR-полиморфные участки генов eNOS, DAT1, hSERT, D1S80, PAH и ApoB). Объектами исследования послужили шесть районных популяций четырех областей Центральной России: Михайловский и Спасский районы Рязанской области, Боровский и Барятинский районы Калужской области, Петровский район Тамбовской области, Болховский район Орловской области (рис. 1). Выбор данных популяций Центральной России в качестве объектов исследования обусловлен особенностями их формирования в X-XVIII в.в.: различным славянским субстратом, разнонаправленностью миграционных потоков в эти популяции разных территориальных групп русских. В настоящее время данные области входят в состав Центрального Федерального Округа России. Их население практически однонационально: русские составляют 95-98%.

На долю других национальностей приходится 2-5%.

Рис.1. Территориальное расположение ряда областей Центральной России (отмечены районы, в которых производился сбор материалов для исследования).

Общий объем генетически изученной выборки составил человека, представляющих коренное русское население четырех областей Центральной России. Из которых 176 коренных русских проживают в Рязанской области (86 человек - Михайловский район, человек - Спасский район), 148 – в Калужской области (71 - Боровский район, 77 - Барятинский район), 78 – в Тамбовской области (Петровский район) и 82 – в Орловской области (Болховский район). Средний возраст исследуемого населения составил 49,2 года. Одна из задач работы – выявить, существуют ли межпопуляционные различия между территориально близкими популяциями русского народа. Поэтому для исследования были выбраны территориально близкие популяции в пределах четырех областей Центральной России: среднее расстояние между изучаемыми популяциями составляет 210 км.

Во всех популяциях в выборки включались только неродственные (до третьей степени родства) индивиды, все предки которых на глубину трех поколений происходят из данной популяции и принадлежат данному этносу. Отбор образцов крови осуществлялось согласно международным стандартам с письменного согласия обследуемых и под контролем Этической комиссии ГУ МГНЦ РАМН. Этническую и популяционную принадлежность определяли путем индивидуального опроса.

Полевой сбор образцов проведен В.С. Ващилиным, И.К.

Аристовой, Н.А. Рудых, Л.А. Цапковой под рук. д.б.н. Е.В. Балановской и проф. М.И. Чурносова.

Материалом для лабораторного исследования послужила венозная кровь. Общий объем полученного образца составил 8-9 мл. Забор венозной крови производили в пробирки с консервантом, содержащим 0,5М раствор ЭДТА (рН=8,0), тщательно перемешивали и хранили при температуре 4С не более одной недели. ДНК выделяли из периферической крови методом фенольно-хлороформной экстракции [Mathew C.C., 1984].

Анализ молекулярно –генетических маркеров проводили методом полимеразной цепной реакции синтеза ДНК с использованием стандартных олигонуклеотидных праймеров [Ахметова В.Л., 2001, Галеева А.Р.и др., 1999, 2001, Спиридонова М.Г. и др., 2002, Das B.et al, 2004, Misrahi M.et al, 1998, Renges H.H. et al, 1992].

Идентификацию аутосомных ДНК локусов, осуществляли стандартным методом вертикального электрофореза в 6,0-7,0% полиакриламиде (CCR5, VNTR-PAH, hSERT, ApoB и D1S80) [Галеева и др., 2002, Херрингтон и др., 1999, Misrahi et al., 1998], или методом горизонтального электрофореза в 2% агарозном геле (АСЕ, eNOS и DAT1) [Спиридонова и др., 2002, Галеева и др., 2002].

Статистический анализ. Определение частот аллелей, генотипов, оценку соответствия характера распределения частот генотипов равновесию Харди-Вайнберга (2), расчет наблюдаемой (HО) и ожидаемой гетерозиготности (HЕ), индекса фиксации Райта (D) производили по стандартным формулам [Животовский, 1983;

Спицын и др., 1996;

Ли, 1978]. Показатели генной идентичности (IT), общего (HT), внутрипопуляционного (HS) и межпопуляционного (GST, DST) генетического разнообразия рассчитывали согласно Nei [1973, 1977].

Генетические расстояния между популяциями были рассчитаны с помощью программы DJ genetic (версия 0,03 beta), разработанной Ю.А.

Серегиным и Е.В. Балановской в ГУ МГНЦ РАМН.

На основе полученных матриц генетических расстояний были построены дендрограммы, проведено многомерное шкалирование;

по корреляционным матрицам - факторный анализ [Дерябин, 2001] с использованием пакета статистических программ Статистика (версия 6).

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 1. Оценка генетического полиморфизма населения Центральной России.

Среди населения Центральной России частоты аллелей изученных аутосомных ДНК локусов составили:

8 ACE*D=0,536, CCR5*ccr5=0,091, eNOS*B=0,790, DAT1*8=0,005, DAT1*9=0,234, DAT1*10=0,753, DAT1*11=0,004, hSERT*9=0,028, hSERT*10=0,361, hSERT*12=0,610, VNTR-PAH*380=0,355, VNTR-PAH*500=0,124, VNTR-PAH*530=0,367, VNTR-PAH*560=0,102, VNTR-PAH*650=0,047, D1S80*18=0,287, D1S80*20=0,033, D1S80*21=0,015, D1S80*22=0,070, D1S80*24=0,322, D1S80*25=0,046, D1S80*26=0,014, D1S80*28=0,047, D1S80*29=0,027, D1S80*30=0,019, D1S80*31=0,064, D1S80*32=0,014, ApoB*30=0,056, ApoB*32=0,055, ApoB*34=0,264, ApoB*36=0,378, ApoB*38=0,045, ApoB*40=0,026, ApoB*42=0,045, ApoB*44=0,016, ApoB*46=0,010, ApoB*48=0,029, ApoB*50=0,039, ApoB*52=0,019.

Следует отметить, что среди русских Центральной России частоты аллелей ACE*D, DAT1*10, D1S80*18, D1S80*24, D1S80*30, ApoB*34, ApoB*36, VNTR-PAH*380, VNTR-PAH*530 имеют четко выраженный западно-евразийский характер распределения.

В результате анализа распределения ДНК-локусов ядерного генома в популяциях Центральной России были выявлены аллели, изменчивость которых на изучаемой территории характеризуется наличием определенных географических закономерностей. Установлен четкий географический градиент в изменчивости аллелей D1S80*24, D1S80*28, ApoB*32. Для аллеля D1S80*28 наблюдается широтная изменчивость: снижение частоты с севера (0,07) на юг (0,02) на изученной территории. Иной географический градиент характерен для аллелей D1S80*24 и ApoB*32: на рассматриваемой территории частота аллеля D1S80*24 снижается в направлении с северо-запада (0,37) на юго-восток (0,26), а концентрация аллеля ApoB*32 уменьшается с юго запада (0,09) на северо-восток (0,02). Для ряда аллелей (DAT1*9, DAT1*10, hSERT*10, hSERT*12, VNTR-РАН*530) прослеживается географическая изменчивость, связанная с пиком падения или возрастания частоты на отдельных территориях Центральной России по линии «юго-запад - северо-восток». Наличие пояса максимальных (минимальных) частот по линии «север-юг» выявлено для аллелей CCR5*ccr5, VNTR-РАН*380, ApoB*36, а зона подъема или спада концентрации аллелей по линии «запад-восток» обнаруживается для аллелей eNOS*B, D1S80*18, D1S80*31, VNTR-PAH*500.

Генетическая дифференциация русских популяций 2.

Центральной России.

По данным о частотах 56 аллелей 8 аутосомных ДНК локусов дана оценка генетических различий населения Центральной России.

Установлено, что уровень генной дифференциации коренного русского населения Центральной России составляет G ST =0,0054. Наибольший вклад в его формирование вносит система CCR5 (GST=0,0094). Действие стабилизирующего отбора в популяциях Центральной России можно предположить в отношении локусов ACE (GST=0,0030) и hSERT (GST=0,0029), которые характеризуются наименьшим уровнем генной дифференциации (GST0.0030). Системы eNOS (GST=0,0052) и VNTR PAH (GST=0,0046) имеют селективно-нейтральную изменчивость.

Полученная нами на модели шести районных популяций оценка генного разнообразия населения Центральной России по данным о частотах 56 аллелей 8 аутосомных ДНК маркеров - G ST =0, согласуется с аналогичным показателем, рассчитанным И.К. Аристовой [2008] по этим же популяциям Центральной России по частотам аллелей 11 иммуно-биохимических маркеров - G ST =0,0035. При этом наши данные полностью совпадают с показателями генетической дифференциации, рассчитанными для популяций юга Центральной России (Белгородская, Курская, Воронежская и Орловская области) М.С.

Жерлицыной [2006] по данным о частотах 29 аллелей 11 иммуно биохимических маркеров - G ST =0,0052 и В.Ю. Песик [2007] по частотам 59 аллелей 8 аутосомных ДНК маркеров - G ST =0,0059. Следует подчеркнуть, что эти показатели генетической дифференциации населения Центральной России и юга Центральной России, полученные независимо друг от друга, по иммуно-биохимическим и ДНК маркерам полностью согласуются с корректной оценкой fr*=0,0062 (характеризует вклад в подразделенность населения районного уровня популяционной системы), рассчитанной И.Н. Сорокиной [2007] по 20 районным популяциям Белгородской области (юг Центральной России) с использованием данных о частотах всех фамилий (более 60 тыс.

фамилий) всего населения области (более 1млн. человек). Таким образом, проведенный сравнительный анализ уровня генетической дифференциации населения Центральной России с использованием данных по разным типам маркеров (аутосомных ДНК маркеров, иммуно-биохимических, квазигенетических) показал их совпадение G ST =0,0040,0050,006, что свидетельствует, с одной стороны, о корректности проведенной нами оценке генного разнообразия населения Центральной России на основе частот аутосомных ДНК маркеров, с другой стороны, еще раз подтверждает установленную Ю.Г. Рычковым и Е.В. Балановской [1987] закономерность – средняя дифференциация популяций GST по классическим и ДНК маркерам одинакова.

3. Таксономический анализ популяций Центральной России.

С использованием методов многомерной статистики проведено исследование генетических соотношений популяций Центральной России между собой. В анализ были включены шесть изученных нами районных популяций и популяция Ливенского района Орловской области, также территориально относящаяся к Центральной России, представленная выборкой коренных русских жителей и изученная нашим коллективом ранее [Песик, 2007] по единой панели аутосомных ДНК маркеров (рис. 2). Установлено, что семь рассматриваемых популяций Центральной России дифференцируются на два кластера:

первый – «юго-восточный» включает Спасский район Рязанской области Болховский район Орловской области Боровский район Калужской области Михайловский район Рязанской области Барятинский район Калужской области Петровский район Тамбовской области Ливенский район Орловской области Спасский район Рязанской области Рис. 2. Расположение в пространстве трех главных факторов семи изученных популяций Центральной России (по частотам 56 аллелей аутосомных ДНК локусов).

и Ливенский район Орловской области, второй – «северо-западный» состоит из Болховского района Орловской области и Боровского района Калужской области. Наряду с этим, рассматриваемые нами Михайловский район Рязанской области, Барятинский район Калужской области и Петровский район Тамбовской области не входят в вышеперечисленные кластеры.

Следует отметить, что расположение популяций в генетическом пространстве соответствует их реальному географическому расположению (рис. 3). Граница генетической дифференциации населения Центральной России проходит через территории Орловской, Тульской и Рязанской областей по линии «юго-запад – северо-восток» и согласуется с изменчивостью ряда аллелей (DAT1*9, DAT1*10, hSERT*10, hSERT*12, VNTR-PAH*530).

Рис. 3. Схема географического расположения семи популяций Центральной России (овалами обведены популяции, которые формируют кластеры при кластерном анализе, многомерном шкалировании и факторном анализе).

Выявленная нами дифференциация популяций Центральной России хорошо согласуется с историей формирования населения этого региона. Так, согласно историческим данным [Восточные славяне…, 2002] в X-XII в.в. основу «северо-западного» кластера составляли племена вятичей, а «юго-восточного» кластера – неизвестное славянское племя, мигрировавшее из Донского бассейна, а также вятичи, переместившиеся из верхнеокского региона.

4. Генетические соотношения населения Центральной России с популяциями восточных славян.

Нами проведена оценка места генофонда популяций Центральной России в системе восточнославянского генофонда. Для этого были изучены генетические соотношения коренного русского населения Центральной России со «среднерусской», «среднеукраинской» и «среднебелорусской» популяциями, по данным о частотах 15 аллелей локусов ACE, CCR5, D1S80 и ApoB (лишь по такому количеству аутосомных ДНК маркеров возможно проведение сравнительного анализа восточнославянских популяций). Установлено, что население Центральной России имеет минимальные генетические расстояния со «среднерусской» популяцией (d=0,003), и генетически удалено от «среднеукраинской» и «среднебелорусской» популяций, которые объединяются с русским кластером лишь на уровне d=0,010 (рис. 4).

Полученные нами данные о генетических соотношениях восточнославянских популяций с населением Центральной России, во первых, могут свидетельствовать о значительной схожести структуры генофонда населения Центральной России со «среднерусским» генофондом. Это полностью согласуется с результатами исследований Е.В. Балановской и др.[2001, 2006] «фамильного портрета» русского народа, выполненного на основе 14 тысяч «коренных» фамилий среди 725 тысяч человек из пяти основных регионов (Северный, Южный, Западный, Восточный, Центральный) «исконного» ареала русского народа. При сравнительном изучении регионов по спектру и частотам фамилий авторы установили, что Центральный регион является «действительно центральным в пространстве русских фамилий практически по всем показателям» [Балановская и др., 2006]. С использованием многомерного шкалирования матрицы обобщенных генетических расстояний авторами показано, что регионы средней полосы европейской части России (Западный, Центральный и Восточный) наиболее полно воспроизводят средние характеристики русского генофонда.

Во-вторых, позволяют сделать заключение о незначительной роли украинцев и белорусов в формировании генофонда населения Центральной России. Это подтверждается литературными данными по истории формирования населения Центральной России. Согласно литературным источникам [Восточные славяне…,2002] население Центральной России формировалось в IX-XIII в.в. в результате взаимодействия ряда славянских племен (вятичи и неизвестное славянское племя из Донского региона) с фино-уграми и балтами.

В-третьих, наши результаты, полученные с использованием аутосомных ДНК маркеров, согласуются с данными по этим же популяциям, полученные Аристовой И.К. [2008] с использованием иммуно-биохимических маркеров. В работе Аристовой И.К.

генетические расстояния населения Центральной России со «среднерусской» популяцией оказались наименьшими d=0,002, тогда как генетические дистанции популяций Центральной России с украинцами и белорусами были более чем в два раза выше (d=0,004 0,005).

0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, «среднерусская» Центральная белорусская» украинская» популяция популяция популяция «средне Россия «средне Рис. 4. Дендрограмма генетических соотношений между населением Центральной России и восточнославянскими популяциями (построена методом Уорда по частотам 15 аллелей локусов ACE, CCR5, D1S80 и ApoB).

5. Оценка места генофонда населения Центральной России в системе евразийского генофонда.

Одной из задач нашего исследования явилось изучение положения генофонда населения Центральной России в системе евразийского генофонда. С использованием данных о частотах 19 аллелей аутосомных ДНК локусов (ACE, CCR5, VNTR-РАН, eNOS и ApoB) установлено (рис. 5), что генофонд населения Центральной России обнаруживает наибольшую генетическую близость к генофонду Восточной Европы. Наблюдается генетическое сходство жителей Центральной России и с другими европейскими популяциями (Западная Европа, Центральная Европа) и их удаленность от народов Приуралья и Северного Кавказа. Максимальные генетические различия население Центральной России имеет с народами азиатского региона. Полученные нами данные полностью согласуются с общими представлениями об этногенетических процессах в Евразии [Восточные славяне…, 2002].

Приуралье Северный Кавказ Восточная Азия Восточная Европа Центральная Россия Западная Европа Рис. 5. График трехмерного шкалирования, отражающий положение населения Центральной России среди регионов Евразии (по данным о частотах 19 аллелей 5 полиморфных локусов АСЕ, CCR5, eNOS, VNTR-PAH и АроВ).

ВЫВОДЫ 1. Охарактеризована структура генофонда русских популяций четырех областей Центральной России (6 популяций, 484 человека) по данным о распределении частот 56 аллелей 8 аутосомных ДНК маркеров: АСЕ, CCR5, eNOS, DAT1, hSERT, D1S80, VNTR-PAH и ApoB.

2. Генетическая гетерогенность населения Центральной России, изученная по аутосомным ДНК маркерам ( G ST =0,005), соответствует литературным данным по иммуно-биохимическим ( G ST =0,004) и квазигенетическим маркерам (fr*=0,006).

3. Популяции Центральной России дифференцируются на два кластера – «юго-восточный» и «северо-западный», что позволяет обосновать гипотезу о различном славянском субстрате этих групп популяций.

4. Население Центральной России формирует общий кластер со «среднерусской» популяцией, который генетически удален от «среднеукраинской» и «среднебелорусской» популяций.

5. В системе евразийского генофонда популяции Центральной России имеют наибольшую близость к генофонду населения Восточной Европы и максимальную генетическую удаленность от популяций азиатского региона.

СПИСОК РАБОТ, ОПУБЛИКОВАННЫХ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ:

1. Ващилин В.С. Особенности инсерционно-делеционного полиморфизма гена ССR5 в популяциях Калужской и Рязанской областей/ Ващилин В.С. // Сборник трудов юбилейной научной конференции КГМУ и сессии Центрально-Черноземного научного центра РАМН, посвященный 70-летию КГМУ. - Курск, 2005. - Т.1. С.54.

2. Популяционно-генетические характеристики русского населения Центральной России/ Чурносов М.И., Балановская Е.В., Лепендина И.Н., Сорокина И.Н., Песик В.Ю., Рудых Н.А., Аристова И.К., Цапкова Л.А., Ващилин В.С., Жерлицина М.С. // Сборник трудов юбилейной научной конференции КГМУ и сессии Центрально-Черноземного научного центра РАМН, посвященный 70-летию КГМУ. - Курск, 2005. - Т.1. С.189-190.

3. ДНК – полиморфизм гипервариабельного локуса ApoB в четырех русских популяциях Центральной России / Ващилин В.С., Песик В.Ю., Балановская Е.В., Чурносов М.И. // Медицинская генетика. 2005. - Т.4.

№4. - С.165 – 166.

4. Материалы по изучению структуры генофонда русского населения Центральной России / Чурносов М.И., Песик В.Ю., Рудых Н.А., Сорокина И.Н., Цапкова Л.А., Ващилин В.С., Лепендина И.Н., Аристова И.К., Жерлицина М.С. // Медицинская генетика. 2005. - Т.4. №6. - С.289.

5. Ващилин В.С. Изучение полиморфизма гена ангиотензин превращающего фермента у русских Центральной России / Ващилин В.С., Балановская Е.В., Чурносов М.И. // Научные ведомости Белгородского Государственного Университета. – Белгород, 2006. - №3.

- С.126 – 128.

6. Полиморфизм минисателлитного локуса гена переносчика серотонина hSERT в одиннадцати популяциях Центральной России / Ващилин В.С., Рудых Н.А., Песик В.Ю., Чурносов М.И., Балановская Е.В. // Материалы международной конференции «Генетика в России и мире», посвященной 40-летию института общей генетики им. Н.И.

Вавилова РАН. - Москва, 2006. - С.27.

7. Ващилин В.С. Полиморфизм минисателлита в гене эндотелиальной синтазы окиси азота у населения Центральной России / Ващилин В.С. // Материалы IX международной научно-практической экологической конференции «Современные проблемы популяционной экологии». - Белгород, 2006. - С.30.

8. Использование различных типов генетических маркеров для описания популяционной структуры населения / Аристова И.К., Балановская Е.В., Ващилин В.С., Жерлицына М.С., Калмыкова Е.В., Лепендина И.Н., Некипелова Е.В., Песик В.Ю., Рудых Н.А., Сорокина И.Н., Цапкова Л.А., Чурносов М.И. // Вестник новых медицинских технологий. 2006. - Т.13. №2. - С.173-176.

9. Описание структуры генофонда русского населения юга Центральной России / Чурносов М.И., Сорокина И.Н., Лепендина И.Н., Аристова И.К., Жерлицына М.С., Песик В.Ю., Рудых Н.А., Цапкова Л.А., Ващилин В.С., Балановская Е.В. // Медицинская генетика. 2006. Т.5. №6. - С.16-20.

10. Популяционные особенности полиморфизма гена ангиотензин превращающего фермента среди населения Центральной России / Ващилин В.С., Рудых Н.А., Песик В.Ю., Чурносов М.И., Балановская Е.В. // Материалы Российской научной конференции с международным участием «Медико биологические аспекты мультифактариальной патологии». - Курск, 2006 - С. 25-29.

11. Генетическая структура населения Центральной России (по данным о полиморфизме гена фенилаланингидроксилазы) / Ващилин В.С., Рудых Н.А., Чурносов М.И., Балановская Е.В. // Сборник трудов 72-й научной конференции КГМУ и сессии Центрально-Черноземного научного центра РАМН. - Курск, 2007. - Т.2. - С.10-11.

Рудых Н.А. Анализ полиморфизма гена 12. VNTR фенилаланингидроксилазы среди населения Центральной России / Рудых Н.А., Песик В.Ю., Ващилин В.С. // Материалы VII конгресса этнографов и антропологов России. - Саранск, 2007. - С.276-277.

13. Рудых Н.А. Распространенность генов аутосомных ДНК локусов среди русского населения / Рудых Н.А., Ващилин В.С. // Вестник РГМУ, 2008. - №2(61). - С. 329.

14. Ващилин В.С. Оценка генетической дифференциации населения Центральной России / Ващилин В.С., Сорокина И.Н., Аристова И.К. // Вестник РГМУ, 2008. - №2(61). - С.271-272.

Ващилин Владимир Сергеевич Изучение аутосомного ДНК полиморфизма в популяциях Центральной России Изучена структура генофонда коренного русского населения Центральной России (6 популяций, 486 человек) по данным о распределении частот 56 аллелей 8 аутосомных ДНК маркеров (I/D АСЕ, CCR5del32, VNTR: eNOS, DAT1, hSERT, D1S80, PAH и ApoB).

Генетическая гетерогенность населения Центральной России, оцененная по аутосомным ДНК маркерам ( G ST =0,005), соответствует литературным данным по иммуно-биохимическим ( G ST =0,004) и квазигенетическим маркерам (fr*=0,006). Популяции Центральной России дифференцируются на два кластера – «юго-восточный» и «северо-западный», что позволяет обосновать гипотезу о различном славянском субстрате этих групп популяций. Население Центральной России формирует общий кластер со «среднерусской» популяцией, который генетически удален от и «среднеукраинской» популяций. Установлены особенности «среднебелорусской» генетической дифференциации популяций Центральной России в системе евразийского генофонда.

Vaschilin Vladimir Sergeevich Studying аутосомного DNA polymorphism In populations of the Central Russia The structure of a genofund of the radical Russian population of the Central Russia (6 populations, 486 person) on the data on distribution of frequencies 56 alleles 8 autosomal DNA markers (I/D АСЕ, CCR5del32, VNTR: eNOS, DAT1, hSERT, D1S80, PAH и ApoB). Genetic heterogeneity of the population of the Central Russia, appreciated on аутосомным ДНК to markers ( G ST =0,005), corresponds to the literary data on immunological and biochemical ( G ST =0,004) and quasigenetic to markers (fr*= 0,006).

Populations of the Central Russia are differentiated on two clasters "southeast" and "northwest", that allows to prove a hypothesis about a various slavic substratum of these groups of populations. The population of the Central Russia forms the general claster with a Russian population which is genetically removed from Ukrainian and Byelorussian populations. Features of genetic differentiation of populations of the Central Russia in system of the Euroasian genofund are established.



 




 
2013 www.netess.ru - «Бесплатная библиотека авторефератов кандидатских и докторских диссертаций»

Материалы этого сайта размещены для ознакомления, все права принадлежат их авторам.
Если Вы не согласны с тем, что Ваш материал размещён на этом сайте, пожалуйста, напишите нам, мы в течении 1-2 рабочих дней удалим его.