Функционирование, механизм регуляции активности и возможное практическое использование голубых медьсодержащих оксидаз
На правах рукописи
Шлеев Сергей Валерьевич Функционирование, механизм регуляции активности и возможное практическое использование голубых медьсодержащих оксидаз Специальность 03.01.04 – «биохимия»
АВТОРЕФЕРАТ
диссертации на соискание ученой степени доктора химических наук
Москва 2010
Работа выполнена в лаборатории химической энзимологии Учреждения Российской академии наук Института биохимии им. А.Н. Баха РАН
Научный консультант: доктор химических наук, профессор Ярополов Александр Иванович
Официальные оппоненты: доктор биологических наук, профессор Звягильская Рената Александровна доктор химических наук, профессор Карякин Аркадий Аркадьевич доктор химических наук, профессор Решетилов Анатолий Николаевич
Ведущая организация:
Учреждение Российской академии наук Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля РАН
Защита состоится «25» ноября 2010 г. в 15 час. на заседании диссертационного совета (Д 002.247.01) при Учреждении Российской Академии Наук Институте биохимии им. А.Н. Баха РАН по адресу: 119071 Москва, Ленинский пр. 33, строение 2, конференц-зал
С диссертацией можно ознакомиться в Библиотеке биологической литературы РАН по адресу:
119071 Москва, Ленинский пр. 33, корп. 1.
Автореферат разослан «22» октября 2010 г.
Ученый секретарь диссертационного совета кандидат биологических наук А.Ф. Орловский
ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ
Актуальность проблемы. Голубые медьсодержащие оксидазы (МСО), к которым относятся лакказа (Lc), билирубиноксидаза (BOx) и аскорбатоксидаза (AOx), а также церулоплазмин (Cp), занимают особое место среди окислительно-восстановительных ферментов. Они обладают высокой удельной активностью и способностью к прямому восстановлению О2 до Н2О без образования промежуточных высоко реакционно-способных токсичных интермедиатов кислорода. Большой интерес, как в фундаментальном, так и прикладном плане, представляет субстратная специфичность этих ферментов, способных окислять широкий круг органических и неорганических соединений. Окисление органических соединений протекает по свободно радикальному механизму, который в настоящее время до конца не изучен. Таким образом, МСО представляют большой интерес с точки зрения фундаментальных исследований их структуры и механизма катализа. Это обусловлено строением активного центра медьсодержащих оксидаз, в который входят ионы меди трех различных типов, координированное взаимодействие которых в процессе каталитического акта одноэлектронного окисления субстратов доноров электронов или атома водорода, позволяет осуществлять восстановление О2 непосредственно до Н2О. Помимо этого, каталитические свойства MCO делают возможным их широкое использование в целлюлозно-бумажной, текстильной, пищевой и косметической промышленностях, а таже медицине. MCO используются для детоксикации и обесцвечивания сточных вод, биодеградации ксенобиотиков, создания антимикробных композиций, получения древесноволокнистых плит, древесных блоков и картона без применения токсичных связующих, при производстве моющих средств и в клиническом анализе.
Интерес к практическому использованию MCO еще более возрос в середине 90-х годов ХХ века, после открытия возможности усиления действия этих ферментов с использованием различных редокс-медиаторов, что позволило существенно расширить область их практического применения. Медиаторы MCO представляют собой субстраты этих ферментов, в процессе окисления которых образуются высоко редокс-потенциальные и химически активные продукты.
Последние могут вступать в реакцию с соединениями, которые не подвергаются окислению одними лишь оксидазами, или участвовать в переносе электронов в электрохимических реакциях, ускоряя электрохимические процессы с участием данных ферментов. Кроме того, в процессе окисления органических субстратов образуются свободные радикалы, которые могут модифицировать другие соединения. Значительный интерес представляет собой использование MCO в органическом синтезе. Показана возможность использования MCO для окисления первичных гидроксильных групп производных сахаров, для синтеза винбластина и бензальдегидов.
Важным направлением практического использования данных ферментов является их применение в биоэлектронике – новой области биотехнологии, сформировавшейся на стыке биологии и электроники и имеющей большое прикладное значение для медицины, высокотехнологичных производств и биокомпьютерных технологий. Основой для создания биосенсоров и биотопливных элементов может быть субстратная специфичность MCO, их высокая активность и стабильность, а также возможность протекания реакции прямого биоэлектрокатализа.
Однако, до сих пор остается неясным детальный механизм функционирования и принципы регуляции активности данного класса ферментов.
Цель работы – установление механизма функционирования и регуляции активности MCO в гомогенных и гетерогенных биокаталитических системах с целью их обоснованного и рационального использования в биокаталитическом синтезе и системах биодеградации ксенобиотиков, для разработки устройств трансформации химической энергии в электрическую, а также для оптимизации электроаналитических сенсоров.
Для достижения поставленной цели были сформулированы следующие основные задачи:
1. Детально изучить биохимические и каталитические характеристики грибных, древесной и бактериальной Lc с целью выбора наиболее перспективных ферментов для использования в различных биотехнологических процессах и биоэлектронных устройствах.
2. Разработать метод экологически чистого синтеза электропроводящего полианилина с участием высоко редокс-потенциальных Lc.
3. Предложить стратегию отбора и исследования потенциальных редокс-медиаторов Lc и провести апробацию лакказа-медиаторных систем (LMS) на практически значимых объектах.
4. Провести комплексное сравнительное спектральное и электрохимическое изучение MCO, включающее, в том числе, и разработку методов и подходов редокс-титрования микроколичеств белков с целью определения редокс-потенциалов их активных центров.
5. Предложить подходы для практического использования MCO в биосенсорах и биотопливных элементах.
6. Выяснить закономерности регуляции активности МСО на молекулярном уровне с использованием биохимических и электрохимических методов. Экспериментально показать “диод-“ и “триод-подобные” свойства биоэлектрохимических устройств.
Научная новизна работы. На основании комплексного исследования основных биохимических и физико-химических свойств, субстратной специфичности и каталитических параметров грибных, бактериальной и древесной Lc выявлены основные критерии отбора Lc из различных таксономических групп для использования в биотехнологии. Детально изучены и систематизированы биоэлектрохимические свойства Lc, BOx и Cp. Предложены новые экспериментальные подходы для исследования активных центров MCO, в том числе разработаны уникальные макро и микро спектроэлектрохимические ячейки. С их использованием были определены значения редокс-потенциалов Т1 центров MCO, а также впервые установлены возможные значения потенциалов некоторых интермедиатов трехъядерного медного кластера ферментов. Сформулированы и экспериментально исследованы пути сопряжения ферментативных реакций MCO и электрохимических процессов с их участием. Комплексные физико-химические и биохимические исследования показали, что механизм и эффективность электронного переноса (ЭП) зависит от ориентации молекул фермента на поверхности электрода. Результаты исследования биохимических, физико-химических, спектральных и электрохимических свойств MCO, субстратной специфичности и механизма действия этих ферментов вносят свой вклад в понимание механизма гомогенного и гетерогенного катализа многоядерными медьсодержащими оксидазами. Теоретически обоснованы и экспериментально доказаны “диод-“ и “триод-подобные” свойства высоко редокс-потенциальной грибной Trametes hirsuta Lc. Высказано предположение о регуляторном значении открытых и исследованых “полупроводниковых” свойств MCO при функционировании данных ферментов в природе.
Обнаружен новый класс редокс-медиаторов Lc (усилителей действия фермента) с общим названием 1-фенил-3-метил-пиразолоны-5 (PP). Подобраны и экпериментально подтверждены научно-обоснованные критерии отбора редокс-медиаторов Lc для создания эффективных систем для обесчвечивания лигноцеллюлозы.
Впервые с участием высоко редокс-потенциальной грибной Lc осуществлен синтез электропроводящего полианилина и изучены его физико-химические свойства.
Практическая значимость. Решение поставленных задач позволило выяснить возможности, ограничения и перспективы использования голубых MCO в различных областях биотехнологии.
На основе различных Lc разработаны амперометрические биосенсоры для определения соединений фенольной структуры и водорастворимого лигнина. Сконструированы и охарактеризованы модели безмедиаторных, безмембранных биотопливных элементов, использующих в качестве топлива глюкозу, а в качестве окислителя – растворенный кислород.
Предложена схема отбора потенциальных редокс-медиаторов Lc и экспериментальные методы их тестирования, что значительно облегчает поиск новых медиаторов фермента. Ряд соединений класса PP отвечают многим требованиям, предъявляемым к усилителям действия ферментов, а именно высокая эффективность, низкая стоимость и экологическая чистота. Показана возможность использования этих соединений для отбеливания лигноцеллюлозы. В частности, проведены лабораторные испытания LMS для делигнификации бумажной пульпы. Разработаны методы ферментативного синтеза электропроводного полианилина с различными свойствами, отвечающие требованиям «зеленой» химии.
Положения, выдвигаемые на защиту:
• особенности механизмов гомогенного и гетерогенного катализа с участием высоко и низко редокс-потенциальных голубых MCO;
• биоэлектрохимические свойства голубых MCO, адсорбированных на электродах из различных материалов;
• обоснование “диод-“ и “триод-подобных” свойств Lc;
• амперометрические биосенсоры на основе голубых MCO для определения соединений фенольной структуры и лигнина;
• модели безмедиаторных, безмембранных биотопливных элементов, использующих углеводы в качестве топлива и растворенный кислород в качестве окислителя;
• схема отбора потенциальных редокс-медиаторов Lc и методы их тестирования;
• разработка методов синтеза электропроводящего псевдоводорастворимого, а также оптически активного полианилина.
Публикации. По материалам диссертации опубликовано 42 научных статьи, получено российских патента. Данные диссертации суммированы в 4 обзорных статьях, а также включены в книгу “Электрохимия белков и нуклеиновых кислот”, выпущенную издательством «Elsevier».
Апробация работы. Материалы диссертационного исследования доложены и обсуждены на российских и международных конференциях, конгрессах, симпозиумах, в том числе: на Международной конференции “Биокатализ-2002” (Москва, Россия, 2002), на Международной конференции “Биотехнология – состояние и перспективы развития” (Москва, Россия, 2002), на XVII и XVIII Международных симпозиумах “Биоэлектрохимия и биоэнергетика” (Флоренция, Италия, 2003 и Коимбра, Португалия, 2005), на 8-ой Международной Пущинской Школе Конференции “Биология - наука XXI века” (Пущино, Россия, 2004), на VI Всероссийской конференции по электрохимическим методам анализа (Уфа, Россия, 2004), на Международных конгрессах электрохимического общества (Квебек, Канада, 2005, Бусан, Корея, 2005, Денвер, США, 2006), на IV Балтийской электрохимической конференции (Грейфсвальд, Германия, 2005), на II Международном Симпозиуме ”Модификация поверхности для химического и биохимического распознавания” (Казимеш Долны, Польша, 2005), на Международной конференции “Электроанализ” (Бордо, Франция, 2006).
Структура диссертации. Диссертация состоит из введения, обзора литературы, материалов и методов, результатов собственных исследований, обсуждения результатов, заключения, выводов и списка использованной литературы. Работа изложена на 322 страницах. Список цитируемой литературы включает 461 наименование. Иллюстративный материал содержит рисунков и 26 таблиц.
Личный вклад автора. Автору принадлежит решающая роль в выборе направления исследований, в развитии и проверке экспериментальных подходов, предложенных в работе, а также в обсуждении, оформлении и обобщении полученных результатов. Экспериментальная работа выполнена самим автором, а также сотрудниками, аспирантами и студентами под руководством автора. В исследованиях, проведенных в соавторстве с зарубежными коллегами, личный вклад автора заключался в постановке задачи, непосредственном участии в экспериментальной работе, в обсуждении полученных результатов и в оформлении их в виде публикаций.
СОДЕРЖАНИЕ РАБОТЫ
Во введении дана общая характеристика диссертационной работы, изложена актуальность темы, сформулированы цели и задачи исследования.
Первая глава содержит обзор литературы, состоящий из шести частей. В первой части описываются строение, свойства и каталитический механизм действия ферментов, относящихся к MCO. Во второй части – основные факторы, определяющие окислительно-восстановительный потенциал этих ферментов. Третья, четвертая и пятая части обзора литературы посвящены описанию AOx, BOx и Cp, соответственно. В шестой части рассматривается строение, свойства и каталитический механизм действия Lc, а также представлено описание основных усилителей действия фермента и LMS. Помимо этого, рассмотрены возможности использования Lc и LMS в биотехнологии.
Во второй главе представлены материалы и методы исследования, включая некоторые оригинальные методики автора с соавторами [Шлеев с соавт., 2000;
Горшина с соавт., 2006а, 2006б].
В работе использовали Lc, выделенные из культуральных жидкостей грибов Trametes hirsuta, Trametes ochracea, Trametes pubescens, Coriolopsis fulvocinerea и Cerrena maxima, а также частично очищенную Myceliophthora termophila Lc - коммерческий препарат фермента фирмы «Novozymes A/S» (Дания). В рамках совместных исследований были любезно предоставлены гомогенный препарат рекомбинантной Lc M. thermophila (LT2), мутантные формы фермента 2B10, 7H9, 3D1, 2E9, и R2 (Др. Мигуэлем Алкаде, Испания), а также гомогенный препарат Cerrena unicolor Lc (Проф. Дж. Рогальски, Польша). В работе были использованы частично очищенные препараты BOx Myrothecium verrucaria (Amano 2) и Trachyderma tsunnodae (Amano 3), фирмы Amano Enzyme Ltd. (Япония). Дополнительная очистка препаратов до гомогенного состояния проводилась Др. Николасом Мано (Франция) в рамках совместных исследований. Частично очищенный препарат Rhus vernicifera Lc, который был любезно предоставлен проф. Бенгтом Рейнхаммером (Швеция), был дополнительно очищен до гомогенного по данным SDS-электрофореза состояния методом HPLC. Рекомбинантный бактериальный фермент Bacillus halodurans, а также Lc аскомицета Lamprospora wrigthii были любезно предоставлены проф. Диетмаром Халтрихом и Др. Роландом Людвигом (Австрия) в рамках выполнения совместных исследований. Помимо этого, в работе использовали Cp, выделенный из крови человека, – высокоочищенный препарат компании Sigma-Aldrich (США). Определение молекулярной массы Lc проводили методом градиентного электрофореза в денатурирующих условиях. Содержание ионов меди определяли бихинолиновым методом [Broman et. al., 1962], а также методом лазерной масс-спектрометрии [Maganadze & Shutyaev, 1993]. Спектральные исследования Lc проводили с использованием спектрофотометра Coulter DU-650 («Beckman», Германия), спектрофлуофотометра RF-5301 PC («Shimadzu», Япония), ЭПР-спектрометра ESC 106 («Bruker», Германия). Определение редокс-потенциала Т1 центра Lc осуществляли методом окислительно-восстановительного титрования, используя в качестве медиаторной пары октоцианомолибдат (IV) и (V) калия [Dutton, 1978;
Xu et al., 1996b]. Определение редокс потенциала Т1 центра BOx осуществляли методом спектроэлектрохимического титрования в присутствии комплексов переходных металлов в качестве медиаторов [Christenson et al., 2006].
Определение рН-оптимума и каталитических констант ферментативных реакций, катализируемых Lc, проводили на кислородном электроде типа Кларка. Спектральные исследования интермедиатов, образующихся при окислении усилителей (медиаторов) Lc, проводили на спектрофотометре «Hitachi-557» (Япония). Спектры кругового дихроизма были записаны с использованием КД дихрографа FKD-2 (Россия). Круговой дихроизм Lc и образцов полианилина измеряли в единицах A, как разность в поглощении лучей с левой и правой круговой поляризацией.
Для анализа продуктов окисления вератрового спирта (VA) LMS использовали метод гидрофобной обратнофазовой жидкостной хроматографии высокого давления. Идентификацию продуктов окисления VA проводили по времени удерживания на колонке, их количество в элюате рассчитывали интегрированием пика элюции с использованием программы “Мультихром” (Россия).
Электрохимические исследования осуществляли с использованием анализаторов CV 50W или CV 100W (BAS, США) работающих в трехэлектродном режиме (рабочий электроды – модифицированные и немодифицированные электроды на основе стеклоуглерода, спектрального графита или золота;
электроды сравнения – хлорсеребряный или каломельный электроды;
вспомогательные электроды – платиновая проволока или золотая пластина).
Спектроэлектрохимические исследования MCO проводили с использованием макро [Шлеев с соавт., 2000] и микро [Larsson et al., 2001] ячеек объемом 1000 мкл и 1 мкл, соответственно.
Масс-спектроскопические исследования проводили с использованием лазер десорбционно ионизирующей (MALDI) масс-спектрометрии на масс-спектрометрическом анализаторе “Applied Biosystems 4700 Proteomics Analyzer” MALDI time-of-flight (TOF) (США). Гидролизаты белков также анализировали с использованием четырехполюсной ионной ловушки Bruker Esquire (Германия) в сочетании с нанораспылителем для их ионизации (ESI-QIT-MS анализ).
В третьей главе представлены результаты диссертационного исследования.
Выделение и основные физико-химические свойства лакказ из различных источников [Королева с соавт., 2001;
Шлеев с соавт., 2003;
Shleev et al., 2004b;
Shleev et al., 2005b;
Никитина с соавт., 2005;
Shleev et al., 2006c;
Shleev et al., 2007a;
Горбачева с соавт., 2008;
Морозова с соавт., 2007а;
Горишна соавт., 2009а, 2009b] Были выделены в гомогенном состоянии Lc из культуральной жидкости базидиальных грибов T. hirsuta, T. ochracea, T. pubescens, C. fulvocinerea и C. maxima, основные биохимические характеристики которых представлены в Таблице 1. Как видно из таблицы, все изученные Lc являются гликопротеинами, характеризуются оптимумом рН в интервале 3,5-5,2 (при использовании в качестве субстрата-донора пирокатехина), значения их изоэлектрических точек (pI) находятся в кислой области рН. Как и большинство описаных в литературе Lc, эти ферменты содержат 4 иона меди на 1 молекулу белка. Необходимо отметить, что все ферменты обладают высокой стабильностью (сохраняют до 50% первоначальной активности через 52-65 часов инкубации при 50°С), что является важным условием для их использования в биотехнологических процессах, биосенсорах и биотопливных элементах.
Таблица 1. Некоторые биохимические характеристики лакказ Углеводы, % Мм, кДа pI pH-оптимум* Т1/2**, ч 70 ± 2 4,2 ± 0. T. hirsuta 3,5-4,5 12 64 ± 2 4,7 ± 0. T. ochracea 3,7-4,9 10 67 ± 2 5,2 ± 0.1 4,0 T. pubescens 67 ± 2 3,5 ± 0. C. maxima 3,5-4,5 13 65 ± 2 3,5 ± 0. C. fulvocinerea 3,9-5,2 32 * При использовании в качестве субстрата-восстановителя пирокатехина ** Время полуинактивации при 50оС В таблице 2 представлены кинетические параметры реакций, катализируемых четырьмя Lc для некоторых органических субстратов и ферроцианида калия. Как видно из таблицы, T. hirsuta Lc обладала наиболее высокими значениями каталитических констант по отношению к органическим субстратам. В то же время, Lc C. maxima показала наибольшее значение k cat при окислении K4Fe(CN)6.
Сравнение кинетических параметров реакций, катализируемых грибной T. hirsuta и древесной Rhus vernicifera Lc (Табл. 3) выявило высокое сродство и эффективность катализа для обеих Lc по отношению к кислороду – природному акцептору электронов данных ферментов. Более того, показана линейная зависимость эффективности катализа, выраженная величиной lg(kкат/KM), от разности между редокс-потенциалами ионов меди Т1 центров ферментов и потенциалами субстратов. Последняя величина – разность потенциалов является движущей силой реакции переноса электронов от субстратов-доноров на фермент. Линейная зависимость эффективности ферментативного катализа от E(фермент-субстрат) указывает на внешнесферный механизм переноса электронов от субстратов на ион меди Т1 центра Lc.
Оптимум рН для всех изученных грибных Lc был приблизительно одинаков и находился в интервале рН 3,5–5,0 при использовании в качестве субстрата-донора пирокатехина (Табл. 1;
Рис. 1А), а кривая зависимости активности ферментов от рН раствора имела колоколообразную форму. При использовании K4Fe(CN)6 активность ферментов монотонно падала при изменении рН раствора от 2,5 до 5,5 (Рис. 1Б). рН-профили активности всех изученных Lc при использовании в качестве субстратов как органического, так и неорганического соединений не отличались от таковых для других Lc, описанных в литературе.
Таблица 2. Кинетические параметры реакций, катализируемых лакказами T. hirsuta T. ochracea C. maxima C. fulvocinerea Субстрат kcat, Kм, kcat/Kм, kcat, Kм, kcat/Kм, kcat, Kм, kcat/Kм, kcat, Kм, kcat/Kм, c-1 мкM мкM-1·c-1 c-1 мкM мкM-1·c-1 c-1 мкM мкM-1·c-1 c-1 мкM мкM-1·c- пирокатехин 390 142 2,75 80 110 0,73 320 120 2,67 90 85 1, гваякол 430 63 6,83 90 90 1,00 300 160 1,88 95 70 1, синаповая кислота 580 24 24,17 170 11 15,45 330 24 13,75 140 21 6, K4Fe(CN)6 400 180 2,22 150 96 1,56 450 115 3,91 130 170 0, * кинетические константы были рассчитаны как средние значения по пяти экспериментам Таблица 3. Сравнение кинетических и термодинамических параметров реакций, катализируемых грибной и растительной лакказами T. hirsuta Rhus vernicifera Потенциал, Субстрат kcat, Kм, kcat/Kм, kcat, Kм, kcat/Kм, мВ c-1 мкM мкM-1·c-1 c-1 мкM мкM-1·c- O2 940 13000* 150 86,67 1300* 200 6, K4[Mo(CN)8] 780 78 670 0,12 0 0 K4[Fe(CN)6] 430 400 180 2,22 64 460 0, * литературные значения (Andreasson et. al., 1979;
Cole et al., 1991;
Matijosyte et al., 2008);
кинетические константы были рассчитаны как средние значения по пяти экспериментам С точки зрения фундаментальных исследований большой интерес представляют структура MCO и механизм катализа. Активный центр Lc содержит 4 иона меди, которые подразделяют на три типа по их спектральным характеристикам: Т1 центр, характеризующийся полосой оптического поглощения в области 600 нм и слабым сверхтонким расщеплениям в спектрах ЭПР;
Т2 центр, невидимый на спектрах поглощения, но характеризующийся на спектрах ЭПР сверхтонким расщеплением;
Т3 центр – биядерный диамагнитный медный центр, который может быть идентифицирован на спектрах оптического поглощения по плечу в области 330 нм.
Cпектры поглощения всех изученных в настоящей работе ферментов были типичными для MCO. В них присутствовали сигналы меди Т1 центра – пик поглощения на 610 нм и биядерного комплекса меди Т3 – плечо в области 330 нм (например, Рис. 2).
Спектры ЭПР, характеризующие ионы меди Т1 и Т2 центров изученных грибных Lc имели сходные характеристики (Рис. 3). На Рис. 4 представлены спектры возбуждения (I) и излучения (II) флуоресценции некоторых исследованных Lc, записанные при комнатной температуре.
Возбуждение в области биядерного медного центра (330 нм) приводит к эмиссии при 432, 438, 436 и 443 нм для T. hirsuta, T. ochracea, C. fulvocinerea и C. maxima Lc, соответственно.
Необходимо отметить, что эти спектры не сильно различаются между собой и хорошо согласуются с литературными данными [Wynn et al., 1983;
Shin et al., 2000].
Изучение вторичной структуры ферментов проводили с помощью спектроскопии кругового дихроизма. Показано, что грибные Lc имели незначительные отличия во вторичной структуре белка. На Рис. 5 представлены типичные КД-спекры двух форм T. pubescens Lc (Lc1 и Lc2).
40 4 А Рисунок 1. Зависимость начальной скорости восстановления кислорода от V0 (ммоль О2 /(мин·мг) рН реакционной смеси, при использовании в качестве субстрата пирокатехина (A) и K4[Fe(CN)6] (Б).
2.5 3.5 4.5 5.5 6. 1 – T. hirsuta;
2 – T. ochracea;
3 – C. fulvocinerea;
4 – C. maxima.
100 Б Условия: 0,1 М цитратно-фосфатный буфер, 80 пирокатехин - 2 мМ, K4[Fe(CN)6] - 10 мМ.
2 3 4 5 рН 1.6 0. 1. Рисунок 2. Спектры оптического 1. поглощения лакказ.
2 0. Поглощение, о.е.
1 – T. hirsuta;
2 – T. ochracea;
3 – C. maxima;
4 – C. fulvocinerea.
0. Условия: 0,1 М фосфатный буфер, pH 6,0;
0. концентрация ферментов около 1 мг/мл.
500 550 600 650 700 750 800 0. 0.2 250 350 450 550 650 750, нм T1 Cu 20 мT Рисунок 3. ЭПР-спектры лакказ.
1 – T. hirsuta;
2 – T. ochracea;
3 – C. maxima;
4 – C. fulvocinerea.
Условия: 0,1 М фосфатный буфер, pH 6,0;
1 концентрация ферментов около 1 мг/мл.
T2 Cu II I 4 Рисунок 4. Спектры возбуждения (I) и Интенсивность флуоресценции излучения флуоресценции (II) лакказ.
1 – T. hirsuta;
2 – T. ochracea;
3 – C. maxima;
4 – C. fulvocinerea.
2 Условия: 0,1 М фосфатный буфер, pH 6,0;
концентрация ферментов около 1 мг/мл.
300 350 400 450, нм КД-спектры Lc были математически обработаны в области длин волн от 190 до 250 нм.
Параметры вторичной структуры белков были рассчитаны с использованием компьютерной программы «Protein-CD», версия 1,5. Программа сравнивает КД-спектры интересующих нас ферментов с КД-спектрами имеющихся в базе данных белков. Результаты расчетов показали, что молекулы грибных Lc (T. hirsuta, T. ochracea, C. maxima, and C. fulvocinerea) содержат около 5% -спиральных участков, 45% -структуры, 20% изгибов и 35% представлено нерегулярной структурой.
Lc Lc Рисунок 5. КД-спекры двух множественных форм лакказы T.
pubescens, Lc1 и Lc2.
Условия: 0,1 М фосфатный буфер (рН 6.0) t = 20°C концентрация ферментов ~ 0,1 мг/мл 190 200 210 220 230 240, нм - - Были проведены сравнительные исследования двух форм Lc базидиомицета T. pubescens и сделан вывод о значительном сходстве биохимических, физико-химических и кинетических свойств обеих форм Lc. Для выяснения вопроса о том, являются ли выделенные ферменты продуктами одного гена, были проведены масс-спектроскопические исследования Lc1 и Lc2.
Анализ гидролизатов Lc1 и Lc2 методом MALDI в области масса/заряд (m/z) 500– показал практически полное сходство аминокислотных последовательностей данных белков (Рис. 6). Исходя из этого, можно предположить, что выделенные ферменты Lс1 и Lс2 являются, скорее всего, продуктами одного гена, т.е. множественными формами одного и того же фермента. Следует отметить, что пять полученных пептидов Lc1 и Lc2 совпадали с описанными в литературе основными пептидами Trametes versicolor Lc. При этом аминокислотная последовательность Lc1 и Lc2 отличалась от данных, имеющихся в литературе по первичной структуре двух изоформ T. pubescens Lc (база данных NCBI, AAM18408 и AAM18407). Таким образом, выделенные нами ферменты являются новыми, ранее не описанными множественными формами Lc T. pubescens. Для сравнения был проведен аналогичный анализ Lc T. hirsuta. Продукты гидролиза этого фермента сильно отличались от таковых для Lс1 и Lс базидиомицета T. pubescens Lc.
Рисунок 6. Суммарный масс-спектрометрический анализ продуктов гидролитического расщепления Lс1 and Lс2.
В результате проведенных исследований были определены основные физико-химические характеристики ферментов и спектральные характеристики ионов меди, входящих в состав активного центра Lc, выделенных из различных источников. Показано сходство биохимических и спектральных параметров исследованных ферментов.
Поиск новых медиаторов лакказ и возможности их использования [Shleev et al., 2003;
Шлеев с соавт., 2004a;
Shleev et al., 2006b;
Shumakovich et al., 2006;
Морозова с соавт., 2007б] Первоначально медиаторами называли соединения – субстраты фермента, в результате окисления которых образовывались устойчивые высокопотенциальные продукты, способные вступать в химические неферментативные реакции с другими соединениями. При этом окисленный медиатор восстанавливался до первоначальной формы и таким образом формировался замкнутый цикл. Простейшая схема функционирования LMS представлена на Рис. 7.
О2 лакказа медиаторок субстрат Рисунок 7. Принцип функционирования LMS.
Н2 О лакказаок медиатор субстраток Оптимальный редокс-медиатор должен быть хорошим субстратом Lc, его окисленная и восстановленная формы должны быть стабильны и не должны ингибировать ферментативную реакцию или инактивировать фермент, процесс его редокс-превращения должен быть циклическим. Соединения, которые в литературе называют медиаторами, на самом деле ими вообще не являются или их можно отнести к медиаторам с большой натяжкой. В первую очередь это связано с низкой стабильностью образующихся интермедиатов и, как следствие, низким числом редокс-циклов. В связи с этим в литературе появился термин «enhancer», т.е. усилитель действия фермента.
Принимая во внимание требования к редокс-медиаторам, была предложена схема отбора органических соединений – потенциальных медиаторов Lc и экспериментальные методы их тестирования, включающая 4 стадии:
1. Отбор соединений на основе анализа структурной формулы с учетом необходимости наличия сопряженных связей и гетероциклических атомов, а также –OH и –NH2 групп.
2. Определение каталитических характеристик отобранных соединений в гомогенных ферментативных реакциях, катализируемых Lc.
3. Анализ циклических вольтамперограмм растворов отобранных соединений в отсутствие и в присутствии модельных соединений лигнина.
4. Прямой эксперимент по анализу продуктов окисления модельного соединения лигнина LMS.
Первичный отбор соединений на основе их структуры Реакционная способность ароматических и гетероциклических соединений часто зависит от природы и положения заместителей. Влияние заместителей на окисление этих соединений определяется как электронными эффектами, так и стерическими факторами. Наша задача состояла в том, чтобы выбрать соединения для использования в LMS с наилучшими каталитическими параметрами в гомогенной ферментативной реакции и оптимальными характеристиками электрохимической реакции на электроде (значение редокс-потенциала, обратимость реакции). При первичном отборе усилителей необходимо учитывать, что введение в структуру соединения тех или иных заместителей должно приводить к увеличению стабильности образующихся в результате реакции радикалов. Окисление соединений, в структуре которых присутствует гидроксильная группа, приводит к образованию нестабильных фенокси-радикалов, способных к реакции конденсации, а наличие аминогруппы вызывает димеризацию/полимеризацию промежуточных форм соединения. Электрон-донорные заместители (алкильная, фенильная и аминогруппы), увеличивая скорость окисления соединения и обеспечивая при этом стабильность образующихся радикалов, уменьшают его окислительно-восстановительный потенциал соединения. Электрон-акцепторные группы (например, карбоксильная или сульфо- группы), увеличивают окислительно-восстановительный потенциал соединения [Xu et al., 2001] и улучшают его растворимость в водных растворах. При отборе соединений в качестве усилителей действия Lc необходимо принимать во внимание, что их редокс-потенциал должен быть выше 450 мВ [Bourbonnais et al., 2000], в противном случае они не могут принимать участие в окислении нефенольных подструктур лигнина.
В силу возможного масштабного коммерческого использования медиаторов, эти соединения должны быть доступны и иметь при этом низкую стоимость. Поиск нетоксичных гетероциклических соединений показал, что одним из наиболее перспективных классов органических соединений, которые могли бы использоваться в качестве медиаторов Lc, являются соединения с общим названием 1-фенил-3-метил-пиразолоны-5, которые производятся в промышленных масштабах и имеют низкую себестоимость (Рис. 8). Одним из наиболее известных соединений данного класса является метамизол натрия или анальгин (PPA-Na), который используется в медицинской практике в качестве обезболивающего средства.
1-фенил-3-метил-пиразолоны-5 относятся к гетероциклическим соединениям, содержащим в своем составе два заместителя электрон-донорной природы – метильную и фенильную группы и присутствуют в растворе в виде двух таутомерных форм (Рис. 8).
H3C H3C C CH2 C CH Рисунок 8. Таутомерные превращения N C N C O OH фенилметилпиразолонов N N Субстратная специфичность Были исследованы около двадцати соединений различной структуры, в том числе гетероциклических, N-OH соединений и производных бензойной кислоты. Исследования гомогенных реакций с участием T. hirsuta Lc позволили отобрать соединения, которые могут являться усилителями фермента. Среди этих соединений выраженные субстратные свойства по отношению к Lc обнаружены у 1-фенил-3-метилпиразолона-5 (РР), его сульфо- (mSPP и pSPP) и аминопроизводных (PPA и PPA-Na), а также у N-гидроксифталеимида (HPI) и 3-амино-(6 гидрокси)-бензойной кислоты (HABA). Структурные формулы этих соединений представлены на Рис. 9.
H3C H3C H3C N N N OH N OH OH N N SO3H SO3H mSPP pSPP РР 1-(4’-сульфофенил)- 1-(3’-сульфофенил) 1-фенил-3 метилпиразолон-5 3-метил-пиразолон-5 3-метил-пиразолон- Рисунок 9.
CH NH H3C H3C N Структурные CH2SO3Na N формулы N N O OH N H3C органических веществ – потенциальных медиаторов лакказ.
PPA-Na PPA 1-фенил-3-метил-4-метиламино 1-фенил-2,3-диметил 4-аминопиразолон-5 пиразолон-5-N(4)-метансульфонат натрия O NH C N OH HO C C O HO O HPI HABA N-гидроксифталеимид 3-амино-(6-гидрокси)-бензойная кислота Исследование зависимости начальной скорости гомогенных ферментативных реакций от концентрации исследуемых соединений показало, что кинетика реакций описывается уравнением Михаэлиса-Ментен. Для оценки эффективности взаимодействия Lc с этими соединениями было проведено их сравнение с одним из лучших субстратов Lc – гидрохиноном (HQ). Результаты представлены в Таблице 4. Как видно из Таблицы, производные PP с сульфогруппой в фенильном кольце (pSPP и mSPP), либо аминогруппой в гетероцикле (PPA), являются субстратами, сравнимыми по своим каталитическим константам с HQ. Эффективность процесса ферментативного окисления РР намного ниже, что, возможно, связано с его гидрофобностью.
Введение в гетероцикл фенилметилпиразолона электрон-донорных групп (аминогруппы в положение 4 и метильной группы в положение 2) увеличивает значение kкат/Kм в случае PPA более чем в 18 раз по сравнению с PP. Однако, это значение в несколько раз меньше, чем для сульфо-производных фенилметилпиразолона. В случае PPA-Na, введение заместителей (метильной и метан-сульфоновой групп) в аминогруппу мало отражается на скорости ферментативной реакции, но значение Км увеличивается более чем в 10 раз. Возможно, более слабое взаимодействие Lc с PPA-Na объясняется проявлением стерического фактора.
Взаимодействие Lc с HPI характеризуется низким сродством этого субстрата к ферменту и низкой скоростью реакции, а HABA является субстратом Lc, сравнимым по своим кинетическим параметрам с HQ.
В отличие от производных фенилметилпиразолона, при высоких скоростях развертки потенциала система с HPI квазиобратима, что подтверждается наличием катодного пика на вольтамперограммах. Потенциал средней точки между катодным и анодным пиками равен мВ, и его условно можно принять за редокс-потенциал этой пары. По-видимому, при низких скоростях развертки потенциала продукт, образующийся при окислении, недостаточно стабилен и не успевает восстановиться на электроде. Таким промежуточным продуктом может быть NO• радикал, как это было показано для таких медиаторов, как HBT и TEMPO [Bourbonnais et al., 1998;
Xu et al., 2000;
Fabbrini et al., 2002].
Описанные выше интермедиаты субстратов Lc образуются за счет их неферментативного окисления на электродах. Зависимость максимального анодного тока от квадратного корня из скорости развертки потенциала имеет линейный характер, что свидетельствует о том, что для всех исследованных соединений электродный процесс протекает в диффузионно контролируемом режиме.
Таблица 4. Кинетические и электрохимические параметры субстратов лакказ Соединение kкат, с-1 Kм, мМ (kкат/ Kм)·10-4, М-1с-1 E1/2, мВ I/Iдиф** HQ 52,0 0,3 17,3 -20 -- PP* 9,7 2,1 0,46 430 0, mSPP 51,5 0,22 23,4 660 1, pSPP 43,9 0,29 15,0 570 0, PPA 35,1 0,41 8,66 0, PPA-Na 36,5 5,0 0,73 -- HPI* 3,6 6,0 0,06 870 2, HABA 43,4 0,28 15,5 390 -- E1/2 – потенциал полуволны окисления субстрата (скорость развертки потенциала 5 мВ/с);
Iдиф – анодный ток окисления медиатора;
I – прирост анодного тока при окислении медиатора (0,2 мМ) в присутствии VA (2 мМ).
Примечания:
Рабочие растворы содержали 2% этилового спирта ** Определение I и I диф проводили при потенциале 1000 мВ Потенциалы полувысоты анодного пика для всех изученных производных фенилметилпиразолона, а также для HPI и HABA, представлены в Таблице 4. Как и следовало ожидать, потенциал полувысоты анодного пика зависел от природы заместителя в структуре фенилметилпиразолонов.
Рисунок 10. Циклические 4 mSPP HPI вольтамперные кривые mSPP и HPI.
Ток, мкА Условия: 0,1 М цитратно-фосфатный - - буфер, pH 5,0;
-8 концентрация медиаторов – 0,2 мМ;
- скорость развертки потенциала:
- - 1 - 5 мВ/c, 2 - 25 мВ/c, -16 - 3 - 100 мВ/c, 4 – 200 мВ/c 0 200 400 600 800 1000 1200 0 200 400 600 800 1000 Е, мВ отн. Ag/AgCl Е, мВ отн. Ag/AgCl Он увеличивался при введении электрон-акцепторной сульфогруппы в фенильное кольцо (mSPP и pSPP) и уменьшался при введении в гетероцикл электрон-донорной аминогруппы (РРА).
Спектральные исследования интермедиатов, образующихся при окислении усилителей, в присутствии лакказы Trametes hirsuta Были проведены дополнительные спектральные исследования продуктов гомогенного окисления двух соединений класса фенилметилпиразолонов – PPA-Na и mSPP в присутствии T.
hirsuta Lc.
В случае PPA-Na спектры поглощения интермедиатов, образующихся в результате ферментативного окисления, зависели от соотношения концентраций медиатора и фермента в растворе (Рис. 11), что указывало на возможное образование нескольких промежуточных продуктов окисления медиатора.
Основываясь на электрохимических данных по гетерогенному окислению PPA-Na, можно предположить существование как минимум трех основных промежуточных продуктов ферментативного окисления данного субстрата (с потенциалами максимумов анодных пиков 290, 570, и 770 мВ).
При ферментативном окислении mSPP, по-видимому, образуются два интермедиата (Рис. 12). При этом продукт с максимумом поглощения при 340 нм является более высоко редокс-потенциальным, т.к. его формирование протекает на более поздней стадии ферментативной реакции. Можно предположить образование двух основных интермедиатов mSPP со значениями потенциалов 660 и 850 мВ, соответствующими максимумам поглощения при 270 и 340 нм, соответственно. При этом образование первого продукта при ферментативном окислении является быстрым процессом, в то время как образование второго продукта процесс более медленный. Похожее двухступенчатое поведение при ферментативном окислении было показано для ABTS, что позволяет предположить сходство механизмов ферментативного окисления обоих субстратов Lc [Bourbonnais & Paice, 1990;
Sols-Oba et al., 2005].
Электрохимическое окисление вератрового спирта в присутствии медиаторов Методом циклической вольтамперометрии было изучено взаимодействие отобранных соединений с модельным соединением лигнина – вератровым спиртом (VA). Этот метод позволяет исследовать не только электродные процессы, но и сопряженные с ними химические реакции.
В качестве примера на Рис. 13 представлены циклические вольтамперограммы, записанные в растворах VA, медиаторов (mSPP, PPA-Na, HPI), а также смеси VA-медиатор. Необходимо отметить, что VA электрохимически не активен до потенциала 1000 мВ.
В присутствии mSPP (Рис. 13), а также pSPP и РРА, окисление VA происходит с меньшим перенапряжением, чем при прямой электродной реакции. На анодной ветви кривой наблюдается увеличение тока окисления в области потенциала 1000 мВ. В то же время, добавление VA к раствору PPA-Na не приводило к увеличению токов окисления (Рис. 13).
В присутствии VA в растворах HPI наблюдалось значительное увеличение анодного тока в области потенциалов окисления HPI и полное исчезновение тока восстановления на катодной ветви кривой (Рис. 13). Отсутствие катодного тока можно объяснить включением интермедиата электродного окисления HPI в процесс химического окисления VA вблизи поверхности электрода.
Химически восстановленный интермедиат вновь окислялся на электроде, давая увеличение анодного тока. При потенциале 910 мВ и скорости развертки потенциала 5 мВ/с анодный ток в присутствии VA увеличивался в 2,5 раза по сравнению с током в отсутствие VA (Рис. 13), что указывает на регенерацию восстановленной формы медиатора в результате каталитического окисления VA, и на повторное окисление HPI на электроде.
0. 5 PPA-Na – 10-3 M 0. Лакказа – 10-7 М Рисунок 11. Изменение во времени 0.4 спектров поглощения продуктов реакции, образующихся в процессе 0. Оптическая плотность 1 ферментативного окисления PPA-Na, с участием лакказы T. hirsuta при 300 350 400 450 различных концентрациях медиатора PPA-Na – 10-3 M 1. и фермента.
Лакказа – 2•10-6 М 1 – исходный спектр;
2 – 1 мин;
0. 3 – 10 мин;
4 – 30 мин;
5 – 60 мин.
0. 4 Условия: 0,1 М цитратно-фосфатный буфер, 0.3 рН 5.0.
350 450 550 650 750, нм Рисунок 12. Изменение во времени Оптическая плотность спектров поглощения продуктов mSPP – 10-4 M 3 реакции, образующихся в процессе 0. Лакказа – 10-6 М ферментативного окисления mSPP с 0. участием лакказы T.hirsuta:
0.4 1 – исходный спектр;
0. 2 – 10 мин;
3 – 30 мин.
Условия: 0,1 М цитратно-фосфатный буфер, 230 280 330 380 рН 5.0.
, нм До потенциала 1000 мВ не наблюдалось ускорения электроокисления VA в присутствии низкопотенциального продукта электродного окисления HABA, редокс-потенциал которого составляет 390 мВ.
В Таблице 4 представлены соотношения прироста анодного тока в растворе, содержащем VA и медиатор, к диффузионному току окисления самого медиатора при потенциале 1000 мВ. Как видно из таблицы, эффективность электрокаталитического окисления VA возрастала с увеличением потенциала полуволны окисления усилителя. При взаимодействии с VA эффективными являлись соединения, имеющие потенциал полувысоты волны окисления выше 500 мВ.
mSPP HPI PPA-Na 0 1 -3 - Ток, мкА -2 - 2 - 2 - - -4 - - - 3 -6 -18 - 200 500 800 1100 200 500 800 1100 250 550 85 0 Е, мВ (отн. Ag/AgCl) Рисунок 13. Циклические вольтамперные кривые, зарегистрированные в растворах (1) медиатора (0.2 мМ);
(2) вератрового спирта (2 мМ) и (3) смеси медиатора и вератрового спирта в тех же концентрациях Условия: 0.1 М цитратно-фосфатный буфер, рН 5.0;
скорость развертки потенциала 5 мВ/с Окисление вератрового спирта в системе лакказа/редокс усилитель фермента Для выяснения эффективности исследуемых медиаторов при деградации модельного соединения лигнина – VA, были проведены прямые эксперименты по окислению VA LMS в гомогенном растворе. Продукты окисления разделяли методом HPLC. Идентификацию продуктов окисления VA проводили по времени их удерживания на колонке. В качестве маркеров использовали VA, вератровый альдегид и вератровую кислоту, количество которых в элюате рассчитывали интегрированием пика элюции с использованием программы “Мультихром” (Россия). Для оценки эффективности аналогичный эксперимент проводили с использованием ABTS в качестве медиатора.
При использовании системы Lc/HPI была достигнута высокая степень превращения VA, сравнимая со степенью окисления спирта в присутствии ABTS. Взаимодействие Lc с гидроксифталеимидом характеризуется низкой скоростью реакции. Однако, как показали электрохимические исследования, образующийся при окислении катион-радикал, способен с довольно высокой скоростью окислять VA. Благодаря этому общая эффективность процесса деградации спирта системой Lc/HPI высока и составляет 70% превращения VA за 48 часов реакции. Иначе обстоит дело с системами Lc/PP. Как показали кинетические исследования (Табл.
4), Lc с высокой скоростью катализирует окисление сульфопроизводных данного класса.
Электрохимическими экспериментами было показано, что продукты окисления этих соединений нестабильны. Однако потенциал и время жизни продуктов окисления оказываются достаточными для того, чтобы окислить VA. Благодаря высокой скорости ферментативного окисления этих производных общая эффективность окисления VA системами Lc/mSPP или Lc/pSPP достаточно высока, в результате чего процент превращения спирта достигает, соответственно, 35% и 30% за 48 часов реакции. Более низкий по сравнению с ABTS процент деградации VA объясняется, по видимому, слабой обратимостью процесса окисления этих производных фенилметилпиразолона.
Как и следовало ожидать на основании электрохимических исследований, в системе Lc/PPA Na скорость окисления VA оказалась значительно ниже, чем при использовании сульфопроизводных PP. В то же время, при использовании PPA-Na окисление VA идет до соответствующей кислоты, в то время как большинство известных к настоящему времени медиаторов окисляют VA до вератрового альдегида [Bourbonnais, Paice, 1990]. По-видимому, несмотря на низкую скорость реакции окисления VA, высокопотенциальные интермедиаты PPA Na, образующиеся в присутствии Lc, способны к дальнейшему окислению вератрового альдегида до вератровой кислоты. Это хорошо согласуется с электрохимическими и спектральными результатами, полученными для PPA-Na.
Контрольные эксперименты показали, что в отсутствие Lc исследуемые нами медиаторы практически не способны к окислению VA, также как и Lc в отсутствие медиаторов окисляет менее 2% VA. Таким образом, производные PP могут использоваться в качестве усилителей действия Lc.
Ферментативный синтез полианилина [Ярополов c соавт., 2007, 2008;
Karamyshev et al., 2003;
Vasil'eva et al., 2007] Полианилин является одним из наиболее важных электропроводящих полимеров в силу своей высокой химической стабильности, относительно высокой электропроводности, простоты получения и возможности изменять свои физико-химические характеристики при изменении температуры, рН раствора, электрического потенциала. Это обуславливает возможность использования электропроводящего полианилина в различных областях, таких как создание хемо- и биосенсоров, антистатических и антикоррозионных покрытий, в микроэлектронике и светоизлучающих устройствах, для разделения изомеров оптически активных соединений. В настоящей работе описываются ферментативный способ получения водной дисперсии наночастиц электропроводящего полианилина и полисульфокислоты, а также безматричный способ получения оптически активного полианилина.
В качестве катализатора реакции окислительной полимеризации мономера использовали высокоочищенные препараты Lc из культурального фильтрата базидиального гриба T. hirsuta.
Использованная в работе Lc является кислотостабильным ферментом, что важно при проведении ферментативного синтеза, осуществляемого при кислых значенях рН.
Матричный синтез интерполимерного комплекса наночастиц электропроводящего полианилина и сульфополистирола Полимеризацию анилина проводили при комнатной температуре в присутствии сульфонированного полистирола как матрицы для синтеза полимера. Формирование продуктов реакции контролировали спектрофотометрически (Рис. 14). Варьировали следующие параметры синтеза: рН раствора, начальные концентрации фермента, анилина и сульфополистирола.
Исследовались следующие параметры полученных образцов: строение полианилинов с использованием различных видов спектроскопии (Рис. 14), электрохимическая активность с использованием циклической вольтамперометрии, а также электропроводность синтезированных образцов. Показана возможность ферментативного получения водорастворимого электропроводящего полианилина, различающегося по основным свойствам в зависимости от условий синтеза.
Безматричный синтез оптически активного электропроводящего полианилина Использование оптически активного полианилина для создания HPLC сорбентов с целью разделения энантиомеров физиологически активных соединений представляет большой интерес. Поскольку дедопированный полианилин не имеет ассиметричных атомов углерода, оптическая активность полимера (спиралевидная конформация) индуцируется хиральными допантами, среди которых наиболее часто используют энантиомеры сульфокамфорной кислоты (CKK).
Одной из практических задач настоящей работы являлась разработка простого, экологически чистого способа получения оптически активного полианилина. Поставленная задача была решена следующим способом: окислительную полимеризацию анилина проводили в присутствии хирального допанта (R- или S-сульфокамфорной кислот (CKK)) с использованием T. hirsuta Lc.
Ферментативный способ получения хирального полианилина протекает в одну стадию, является экологически чистым и позволяет получать полианилин не загрязненный продуктами восстановления окислителя. При значении рН около 2,8, которое было выбрано оптимальным для получения допированного полианилина, Lc сохраняет ~38% своей первоначальной активности после инкубации в течение 4 суток при температуре 20°С.
Были оптимизированы условия ферментативного синтеза путем варьирования концентраций реагентов (CKK и анилина от 0,025 М до 0,4 М) и их соотношений (от 1:5 до 5:1);
концентрации дикислорода (0,025 mM и 1 mM), рН раствора (2,66,0);
температуры (4°С и 20°С) и концентрации фермента (6•10-8 М и 1,6•10-7 М). Наилучшие результаты были получены при соотношении реагентов анилин:сульфокамфорная кислота=1:1 и их концентраций в интервале 0,10,2 М.
При увеличении концентрации О2 в реакционной смеси по сравнению с раствором насыщенным воздухом, скорость полимеризации возрастает, но при этом несколько усложняется методика эксперимента. Поэтому все эксперименты, приведенные в настоящей работе, проводили на воздухе.
А pH Поглощение pH 2. pH 3. 1 pH 3. pH 4. pH 6. pH 7. pH 8. pH 9. pH pH 10., нм 200 300 400 500 600 700 800 Б Поглощение, см- Рисунок 14. УФ-видимые (А) и ИК (Б) спекры комплекса сульфополистирол-полианилин На рисунке 15 приведены УФ-видимые спектры полианилина, допированного S-CKK, синтезированного in situ, при различных температурах. Видны четко выраженные полосы поглощения в области 750-800 нм, относящиеся к допированной форме полианилина и указывающие на наличие локализованного полярона в структуре полимера.
Методом спектроскопии кругового дихроизма показана оптическая активность ферментативно синтезированного полимера (Рис. 16). Установлено, что спиралевидная конформация основной цепи полианилина является достаточно лабильной и знак оптической активности полимера можно изменить передопированием полученного образца другим энантиомером СКК.
Поглощение Рисунок 15. УФ-видимые спектры пленок ПАНИ / S-СКК, синтезированные in situ на стеклах.
(1) – при 40С и (2) при 200С, нм Рисунок 16. КД-спектры дисперсии ферментативно синтезированного оптически активного (хирального) полианилина в растворе диметилсульфоксида в присутствии:
(1) – S-СКК и (2) – R-СКК.
, нм Комплексное сравнительное изучение медьсодержащих оксидаз [Шлеев с соавт., 2003;
Shleev et al., 2004a, 2005b, 2005c, 2006d, 2007a, 2007b, 2008a, 2008b;
Ferapontova et al., 2005;
Pita et al., 2006;
Christenson et al., 2004, 2006;
Yaropolov et al., 2007;
Nazaruk et al., 2007;
Haghighi et al., 2007;
Zumarraga et al., 2007, 2008a, 2008b;
Горбачева с соавт., 2008;
Vaz-Dominguez et al., 2008;
Ramrez et al., 2008;
Haberska et al., 2009;
Ressine et al., 2010] Определение окислительно-восстановительных потенциалов Т1 центров MCO Одной из основных характеристик MCO является стандартный окислительно восстановительный потенциал Т1 центров ферментов. Значения этого потенциала варьируются у различных MCO от 430 до 1000 мВ отн. NHE [Solomon et al., 1996;
Shleev et al., 2005b]. T1 центр фермента является первичным акцептором электронов, поступающих от субстратов восстановителей. Непосредственно MCO окисляют только те соединения, окислительно восстановительный потенциал которых незначительно превышает редокс-потенциал иона меди Т1 центра фермента [Xu, 1997]. Кроме того, от редокс-потенциала Т1 центра зависит эффективность катализа для большинства субстратов Lc, что делает MCO с высокими потенциалами Т1 центра весьма перспективными объектами для биотехнологических целей, например, для обесцвечивания бумажной пульпы, биоремедиации и деградации различных ксенобиотиков. Определение редокс-потенциалов ионов меди первого типа было необходимо для выявления наиболее высокопотенциальных ферментов, которые, участвуя в реакциях окисления субстратов, приводят к образованию высокопотенциальных интермедиатов, что весьма важно при проведении биотехнологических процессов. Более того, именно применение высоко редокс-потенциальных MCO перспективно с точки зрения создания высокоэффективного биокатода топливных элементов.
Определение редокс-потенциалов Т1 центров MCO осуществляли методом потенциометрическoго титрования в присутствии редокс-медиатора(ов) с использованием разработанных микро и макро спектроэлектрохимических ячеек (Рис. 17).
На рисунке 18 представлены спектры поглощения растворов T. hirsuta Lc, записанных в процессе окислительно-восстановительного титрования с использованием редокс-пары [Mo(CN)8]3-/[Mo(CN)8]4-. Аналогичные данные были получены при окислительно восстановительном титровании T. ochracea, C. fulvocinerea и C. maxima Lc. Восстановление Т медного центра сопровождалось уменьшением пика поглощения в области 610 нм. Следует отметить, что редокс-потенциал системы в данном случае определялся соотношением окисленной и восстановленной форм медиатора.
Другим вариантом потенциометрического титрования в присутствии одного или нескольких редокс-медиаторов является метод электролиза смеси фермента и редокс-медиаторов. Для этой цели использовалась микро спектроэлектрохимическая ячейка с рабочим объемом около 7 мкл (Рис. 17А). Редокс-потенциал системы в данном случае определяется потенциалом, накладываемым на рабочий электрод, а медиатор служит лишь для ускорения достижения редокс-равновесия в системе. Данный метод позволяет значительно уменьшить количество медиатора, а также расширить возможную область потенциалов в процессе редокс-титрования.
А Б Микро (рабочий объем 7 микролитров) Макро (рабочий объем 2000 микролитров) Т1 и Т3 центры (УФ-видимая спектроскопия) Т1 и Т2 центры (УФ-видимая и ЭПР спектроскопия) Рисунок 17. Спектроэлектрохимические ячейки (А: 1 - вывод рабочего раствора;
2 и 3 - вспомогательные электроды;
4 - керамическая втулка;
5 пластмассовая завинчивающаяся крышка;
6 - коническая муфта;
7 - пластиковое крестообразное основание;
8 - золотой рабочий электрод (капилляр);
9 - электрод сравнения;
10 – оптическое волокно.
Б: 1 - кварцевая кювета;
2 - плоский шлиф;
3 - зажим;
4 - ячейка для проведения электрохимических измерений;
5 - трубка ввода газа;
6 - кран;
7 - мешалка;
8 - платиновые электроды;
9 - трубка вывода газа и ввода веществ;
10 - простой шлиф;
11 - водяной затвор;
12 - капилляр;
13 - трубка для соединения рабочего раствора с электродом сравнения;
14 - трубка для шланга) На рисунке 19 представлен пример использования данной методики при редокс-титровании двух множественных форм T. pubescens Lc с использованием редокс-пары [Mo(CN)8]3 /[Mo(CN)8]4-. С помощью данной методики были определены окислительно-восстановительные потенциалы Т1 центров Cerrena unicolor Lc, рекомбинантной M. thermophila Lc (LT2), мутантов фермента 2B10, 7H9, 3D1, 2E9, и R2, M. verrucaria и T. tsunodae BOx, а также Bacillus halodurans MCO.
1. 0. 1. lg[(A/(A0-A)] 1 2 0. Рисунок 18. Изменение спектров 0. 0. лакказы T. hirsuta в процессе -0. Поглощение, опт. ед.
потенциометрического титрования с -1. использованием редокс-пары 760 780 800 820 840 0.030 E, mV [Mo(CN)8]3-/[Mo(CN)8]4-.
Условия: 0,1 М фосфатный буфер (рН 6.0) 0. t = 20°C 1 – 7 мкМ лакказы и 2 мМ [Mo(CN)8]3 2-6 – добавление [Mo(CN)8]4- до конечной концентрации 2 мМ 0. 0. 500 600 700, нм 0. Lc LAC Lc LАС log[(A/(A0-A)] 0. Lc LAC 0.14 Поглощение, отн. ед.
-0. 0.12 - 675 700 725 750 775 800 E / мВ (vs. NHE) 0. Рисунок 19. Спектроэлектрохимическое окислительно-восстановительное 0.08 титрование лакказ Trametes pubescens A (A) Изменение спектра поглощения Lс1 в процессе редокс-титрования. 1 – 5 спектры 0. поглощения фермента при потенциалах 450 500 550 600 650 700 750 раствора 900, 800, 750, 700, и 600 мВ, нм соответственно. Вставка: Кривые 0. титрования Нернста Lc1 и Lc2 в логарифмических координатах.
Lc LAC Поглощение, отн. ед. (614 нм) 0. (Б) Спектроэлектрохимические кривые титрования, показывающие зависимость Lc 0.11 LAC2 поглощения растворов Lc при 614 нм (отражающее окислительно 0. восстановительное состояние меди Т1), относительно редокс-потенциала среды.
0. Условия: 0,022 мM Lc1 и 0,018 мM Lc2;
Б 0.08 0,2 мM K4Mo(CN)6;
0,1 M фосфатный буфер, pH 6,5.
0. 0. 550 600 650 700 750 800 850 E/мВ (отн. НВЭ) Полученные данные о значении окислительно-восстановительных потенциалов Т1 центров MCO представлены в Таблице 5. Все изученные MCO относятся к высоко редокс-потенциальным ферментам и являются высокоактивными в гомогенных реакциях окисления субстратов-доноров.
Дальнейшие электрохимические исследования Lc, проведенные в настоящей работе, представляют интерес для понимания механизма катализа и возможности использования этих ферментов в гетерогенных биоэлектрокаталитических системах.
Таблица 5. Редокс-потенциалы Т1 центра голубых медьсодержащих оксидаз MCO Потенциал Т1 центра, мВ отн. NHE 790 ± Trametes ochracea Lc 780 ± Trametes hirsuta Lc 746 ± Trametes pubescens LAC 738 ± Trametes pubescens LAC 780 ± Coriolopsis fulvocinerea Lc 750 ± Cerrena maxima Lc 750 ± Cerrena unicolor Lc Myceliophthora thermophila LT Myceliophthora thermophila 2B Myceliophthora thermophila 7H Myceliophthora thermophila 3D Myceliophthora thermophila 2E Myceliophthora thermophila R 670 ± Myrothecium verrucaria BOx Trachyderma tsunodae BOx 325 ± Bacillus halodurans бактериальная MCO Редокс-титрование T. hirsuta Lc c одновременной детекцией сигнала Т1 центра посредством видимой и ЭПР спектроскопии, а также специфического сигнала Т2 центра в ЭПР спектре Lc (Рис. 20) показало, что одно из возможных значений редокс-потенциала Т2/T3 кластера значительно ниже окислительно-восстановительного потенциала Т1 центра Lc равного 780 мВ отн. NHE. При проведении данных экспериментов использовалась разработанная автором биоэлектрохимическая ячейка с параллельным спектрометрическим контролем исследуемого вещества (Рис. 17Б).
Редокс-титрование MCO в отсутствие медиаторов Уникальная конструкция микро-спектроэлектрохимической ячейки с общим объемом около 7 мкл (Рис. 17А) позволила провести окислительно-восстановительные титрования MCO, таких как T. hirsuta Lc, M. verrucaria BOx, и T. tsunodae BOx, в отсутствие редокс-медиаторов. В данных экспериментах кривые титрования значительно отличались от кривых, представленных выше.
Наличие четко выраженного гистерезиса в электрохимическом процессе показано для всех изученных MCO. Как видно из рисунков 21 и 22, ход окислительного титрования ферментов отличается от восстановительной ветви кривой титрования.
Используя модельный редокс-белок, азурин, который содержит в своей структуре лишь один ион меди типа 1, было показано, что данное явление связано не столько с отсутствием полного окислительно-восстановительного равновесия в системе, сколько с особыми свойствами MCO, имеющих в своем составе многоядерный медьсодержащий активный центр. Высказано предположение, что электронное поведение MCO, сходное с поведением диодов, а именно значительно различающаяся скорость электронного переноса в ходе окислительного и восстановительного процессов, является внутренним свойством, присущим многим высоко редокс-потенциальным MCO. По-видимому, данное явление связано со специфической ориентацией белка на поверхности золотого рабочего электрода, а именно возможностью электронного контакта Т2/T3 центра ферментов и электрода (Рис. 22Б). Был сделан вывод о том, что одним из возможных редокс-потенциалов Т2/T3 центра высоко редокс-потенциальных MCO является значение близкое к 400 мВ отн. NHE. Анализ литературных данных, а также собственные результаты по электрохимическому поведению MCO на золотых и угольных электродах (см. ниже), подтвердили данное предположение.
0. А Рисунок 20. Изменение спектров Поглощение, опт. ед.
поглощения (А) и ЭПР-спектров (Б) 0. лакказы T. hirsuta в процессе окислительно-восстановительное титрования с использованием различных редокс-медиаторов.
0. Е – начальный спектр фермента 1 – 770 мВ ([Mo(CN)8]3-/[Mo(CN)8]4-) 2 – 450 мВ ([Fe(CN)6]3-/[Fe(CN)6]4-) 0. Условия: 0,1 М фосфатный буфер, рН 6,5.
450 500 550 600 650 700 750, нм T Б E T Т [mT] 0. 0. А Б Поглощение, опт. ед.
0.20 0. Поглощение, опт. ед.
0.18 0. E'm7 = 980 мВ 0. 2 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. E'm7 = 805 мВ 0. 0.04 0. 0.0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 1.0 0.0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 1. Е, В Е, В 0.25 0. В 850 мВ Г Поглощение, опт. ед.
Поглощение, опт. ед.
0. 0. 0. 980 мВ 0. 0. 350 мВ 550 мВ 0. 0. 0. 50 мВ 0. 0. 100 мВ 0. -0. 450 500 550 600 650 700 750 450 500 550 600 650 700 750 Е, В Е, В Рисунок 21. Спектроэлектрохимическое редокс-титрование билирубин оксидаз Myrothecium verrucaria и Trachyderma tsunodae с использованием микро спектроэлектрохимической ячейки.
А и Б – кривые титрования отражающие зависимость поглощения раствора ферментов M. verrucaria и T. tsunodae от приложенного потенциала, соответсвенно.
В и Г – спектры поглощения ферментов M. verrucaria и T. tsunodae в процессе титрования, соответственно.
Условия: 0,1 М фосфатный буфер, рН 7,0.
А Поглощение, опт. ед.
Рисунок 22. Спектроэлектрохимическое редокс-титрование лакказы T. hirsuta с использованием микро спектроэлектрохимической ячейки.
(А) Спектры поглощения лакказы в процессе титрования. Е – спектр нативного фермента, 1-5 – спектры при потенциалах, нм 20, 530, 830 и 1030 мВ отн. НВЭ.
(В) Кривые титрования, отражающие зависимость поглощения раствора фермента Б Поглощение, опт. ед.
от приложенного потенциала.
1 – окислительная кривая титрования и 2 – восстановительная кривая титрования.
Условия: 0,1 М фосфатный буфер, рН 6,5.
золотой электрод Е, мВ Электрохимическое поведение MCO на золотых электродах Исследовано электрохимическое поведение T. hirsuta, T. ochracea и C. maxima Lc, а также T. tsunodae BOx и человеческого Cp, адсорбированных на модифицированных и немодифицированных золотых электродах. Cp, адсорбированный на немодифицированных золотых электродах, также как электродах, модифицированных отрицательно и положительно заряженными тиолами, не обладал электрохимической активностью. Циклические вольтамперограммы золотых электродов, модифицированных 4-аминотиофенолом, с иммобилизованным Cp в отсутствие редокс-медиаторов представлены на Рис. 23.
Иммобилизация Cp на нейтральном слое аминофенола приводила к появлению электрохимической активности фермента, а именно неярко выраженного анодного пика со значением потенциала около 750 мВ отн. NHE. Рассчитанная для одноэлектронного переноса концентрация белка составляла около 8 пмоль/см2 с учетом реальной поверхности золота, имеющей фактор шероховатости около 2. Высота анодного пика слабо зависела от концентрации растворенного О2. Важно отметить полное отсутствие ускорения электрокаталитического процесса восстановления О2 церулоплазмином, иммобилизованным на модифицированных и немодифицированных золотых электродах.
0. 0. 0. Ток, мкА monolayer, air воздух монослой, monolayer, N2 азот монослой, 0. церулоплазмин, воздух ceruloplasmin, air ceruloplasmin, N2 азот церулоплазмин, -0. -0. -0. 100 200 300 400 500 600 700 800 900 Е, мВ Рисунок 23. Циклические вольтамперограммы золотого электрода, модифицированного 4-аминотиофенолом, с иммобилизованным церулоплазмином Условия: 0,1 М фосфатный буфер, рН 7,4;
стартовый потенциал – 1000 мВ;
скорость развертки потенциала – 100 мВ/сек.
Дополнительные элипсометрические исследования адсорбции белка на тиол-модифицированной поверхности позволили расчитать реальную концентрацию Cp при его иммобилизации на 4 аминотиольном монослое (Рис. 24). С учетом молекулярного веса целовеческого Cp, 132 кДа, эта концентрация не превышала 2 пмоль/см2. Сходная ситуация, а именно проявление электрохимической активности без ускорения электровосстановления О2 в отсутствие редокс медиаторов, наблюдалась и при электрохимическом изучении другой MCO – T. tsunodae BOx, иммобилизованной на золотых электродах, модифицированных отрицательно заряженным монослоем тиола (Рис. 25А). При этом фермент, адсорбированный на немодифицированных золотых электродах, также как и на электродах, модифицированных положительно заряженным и нейтральным тиолами, не обладал электрохимической активностью. Широкие катодный и анодный пики (Рис. 25А) отражают электрохимическое восстановление и окисление BOx, ковалентно связанной с поверхностью электрода. Потенциал средней точки фарадеевского процесса равен 360 мВ (отн. NHE), интервал между катодным и анодным пиком соответствует квазиобратимому электрохимическому процессу (56 мВ), рассчитанная поверхностная концентрация фермента – около 10 пмоль/см2. Рассчитанная с использованием Marcus-DOS теории вольтамперометрическая кривая достаточно хорошо описывает Фарадеевский процесс при значениях энергии реогранизации Т1 центра ( Т 1 ) 0,4-0,8 эВ и стандартной константы скорости гетерогенного ЭП ( k 0 ) 0,3 с-1.
2 1, количество (mg/m2) толщина () 2 0, 0 0 10 20 30 40 50 Время, мин Рисунок 24. Адсорбция церулоплазмина на поверхности золота, модифицированной 4-аминотиофенолом 1 – количество адсорбированного фермента на единицу поверхности, 2 – толщина адсорбированного слоя.
Условия: 0,1 М фосфатный буфер, рН 7,4.
Введение в буферный раствор кислорода, также как и ингибирование фторид-ионами адсорбированного фермента, не приводило к появлению значительной разницы в плотностях тока по сравнению с анаэробными условиями для электрода, поляризованного при потенциале +500 мВ (Рис. 25А, вставка). При этом, добавление K3[Fe(CN)6], эффективного медиатора, осуществляющего ЭП независимо от ориентации фермента на поверхности электрода, приводило к появлению ярко выраженного процесса ускорения электрокаталитического восстановления О2 (Рис. 25Б). Аналогичные результаты были получены и для золотых электродов, модифицированных T. hirsuta Lc.
На рис. 26 представлена циклическая вольтамперограмма фермента, адсорбированного на немодифицированном золотом электроде. Потенциал средней точки фарадеевского процесса равен 480 мВ (отн. NHE), интервал между катодным и анодным пиком соответствует квазиобратимому электрохимическому процессу (100 мВ), поверхностная концентрация фермента, рассчитанная с учетом одноэлектронного переноса, – около 4 пмоль/см2. Данная концентрация фермента незначительно превышает количество Lc на единицу поверхности, рассчитанную с учетом элипсометрических исследований (Рис. 27). Следует отметить практически полное отсутствие ускорения электровосстановления О2 Lc, адсорбированной на немодифицированных золотых электродах в отсутствие редокс-медиаторов.
Введение в раствор ABTS приводило к ярко выраженному биоэлектрокаталитическому восстановлению О2 Lc, адсорбированной на золотых электродах. Процесс контролировался как электрохимически (Рис. 28), так и спектрофотометрически с использованием микро спектроэлектрохимической ячейки (Рис. 29).
0, A А O N2 F O N БB 0, j (Acm ) - -0, 4 - -0, Ток, мкА -0, 2 0 200 400 600 - Time (s) - - -4 - 0,1 0,2 0,3 0,4 0,5 0,6 0,7 0,8 0,9 1,0 1,1 0,2 0,3 0,4 0,5 0,6 0, Е, мВ Е, мВ Рисунок 25. Электрохимическое поведение BOx иммобилизованной на золотом электроде, модифицированном монослоем меркаптопропионовой кислоты.
(А) Циклические вольтамперограммы модифицированного золотого электрода в анаэробных условиях. 1 и 2 – в отсутствии и присутствии фермента, соответственно, 3 – вольтамперограмма, теоретические расчитанная полученная с использованием Marcus-DOS теории электронного транспорта. Вставка: хроноамерометрическая кривая электрода, поляризованного при потенциале 500 мВ отн. NHE в анаеробных и аеробных условиях, а также при добавлении 10 мМ F-.
(Б) Вольтамперограммы BOx-модифицированного золотого электрода в присутствии 2 мМ K3[Fe(CN)6].
1 – буфер, насыщенный N2, 2 – буфер насыщенный O2, 3 – буфер, насыщенный O2, с добавлением 10 мМ F-.
Условия: 0,1 М фосфатный буфер, рН 7,0.
Следует отметить, что активность адсорбированного фермента зависела от потенциала, приложенного к золотому электроду. Данное поведение фермента напоминает поведение полупроводниковых транзисторов, в которых скорость ЭП (плотность тока) между вводом и выводом устройства зависит от потенциала, приложенного к контрольному электроду (Рис. 30).
По-видимому, низко редокс-потенциальный процесс, наблюдаемый при использовании золотых материалов, соответствует редокс-трансформации Т2/Т3 кластера MCO за счет специфической ориентации белка на поверхности электрода. Важно также отметить, что активность Lc составляла около 50% при отсутствии потенциала (Рис. 30).
Рисунок 26. Циклическая вольтамперограмма золотого капилярного электрода с адсорбированной лакказой Ток, мкA/см Trametes hirsuta.
Условия: 0,1 М фосфатный буфер рН 5,3;
0,25 мМ О2, скорость развертки потенциала – 10 мВ/с, второе сканирование).
- - -50 150 350 550 750 950 Е, мВ 3 количество (мг/м2) толщина () 2 0 0 10 20 30 40 50 60 Время (мин) Рисунок 27. Адсорбция лакказы T. hirsuta на немодифицированной золотой поверхности 1 – количество адсорбированного фермента на единицу поверхности, 2 – толщина адсорбированного слоя.
Условия: 0,1 М фосфатный буфер, рН 5,3.
А 550 mV - 500 mV - Рисунок 28. Амперометрические 450 mV - Ток, нА исследования окисления ABTS с участием - активность лакказы Trametes hirsuta, адсорбированной - на поверхности золотого капилярного ABTS - электрода.
- А) Хроноамперометрические кривые плоского золотого электрода с - адсорбированным ферментом, записанные - Время, сек при потенциале 550 мВ, 500 мВ, и 450 мВ.
50 70 90 110 130 Б) Зависимость скорости ферментативного - окисления ABTS (выраженное в виде Б катодного тока) от приложенного - потенциала.
- Ток, нА Условия: 0,2 М фосфатный буфер, рН 5,2;
- 0,25 мМ О2.
- - - 300 350 400 450 500 Е, мВ 2. 24 сек А Б HO3S SO3H S S 3. 2.4 N N Поглощение, отн. ед.
N N А (419 нм) H3C CH2 H2C CH 18 сек 2.5 ABTS 1. 2 1. 12 сек 1. 0. 1 6 сек 0.4 0.5 0 -100 100 300 500 700 900 375 400 425 450 475 500 525 550 575, нм Е, мВ (отн. NHE) Рисунок 29. Спектроэлектрохимичесике исследования окисления ABTS с участием лакказы Trametes hirsuta, адсорбированной на поверхности золотого капилярного электрода.
А) Зависимость скорости ферментативного окисления ABTS (выраженная в виде разностей оптического поглощения при длине волны 419 нм) от приложенного потенциала.
Б) Изменение спектров поглощения раствора ABTS во времени при окислении субстрата кислородом в присутствии фермента.
Условия: 0,2 М фосфатный буфер, рН 5,2;
0,25 мМ О2.
А Рисунок 30. A Схема переноса электрона SO3 O3S S S NN между ионами меди лакказы Trametes и N N C2H5 C2H поверхностью золотого электрода.
SO3 O3 S S S Трехмерная структура фермента NN e N N вход смоделирована с использованием программы C2H5 C2H PyMol v. 0.99 на основе струтуры Trametes T versicolor Lc (PDB 1GYC). Белковая глобула выделена зеленым цетом, ионы меди – синим, углеводная часть фермента – черным ВЭП (ВЭП – внутримолекулярный электронный e e- перенос).
выход Б) Изменение активности лакказы T. hirsuta при окислении ABTS в зависимости от T T3 приложенного потенциала.
2H2O + O2 + 4H конроль T Б e золотой электрод Активность (%) ET2/T3 680 mV ET2/T3 400 mV e 100 200 300 Е,400 (отн. NHE) мВ 500 600 800 золотой электрод Для иммобилизации MCO также использовали свежесинтезированные золотые наночастицы различного размера, от 40 до 110 нм. В этом случае, в отличие от золотых макроэлектродов, удалось добиться ПЭП между золотой поверхностью и Т1 центром некоторых ферментов, в частности T. hirsuta Lc, что выражалось в биоэлектрокаталитической активности адсорбированных MCO, проявляющейся уже при высоких потенциалах близких к редокс потенциалу Т1 центра. Рассчитанная k 0 в случае использования T. hirsuta Lc составляла около 0.5 с-1. Плотность тока биоэлектрокаталитического восстановления О2 варьировали (в зависимости от размера наночастиц, рН буферного раствора, и т.д.) в диапазоне от 5 до мкА/см2.
Электрохимическое поведение MCO на электродах из углеродных материалов Методом циклической вольтамперометрии исследованы прямые (безмедиаторные) электрохимические реакции восстановления O2 с участием T. hirsuta, T. ochracea, T. pubescens, C. fulvocinerea и C. maxima Lc, нативной L. wrigthii Lc, рекомбинантной M. thermophila (LT2) Lc и мутантов фермента 2B10, 7H9, 3D1, 2E9, и R2, а также M. verrucaria BOx, T. tsunodae Box, человеческого Cp и бактериальной MCO Bacillus halodurans, адсорбированных на электродах из спектрального графита. В аэробных условиях на электродах из спектрального графита для всех исследованных ферментов показана возможность ПЭП с электрода на фермент. Для T. hirsuta, T. ochracea, C. fulvocinerea, T. pubescens, C. maxima Lc, а также бактериальной MCO B.
halodurans, ПЭП сопровождался ускорением электрокаталитического восстановления О2. На Рис.
31 представлены типичные циклические вольтамперограммы немодифицированных и модифицированных Lc электродов из спектрального графита в насыщенных кислородом буферных растворах. При адсорбции на электродах, все Lc сильно уменьшали перенапряжение реакции электровосстановления молекулярного О2 до Н2О.
15 10 Рисунок 31.
Биоэлектрохимическое восстановление О2 на Ток, мкА Ток, мкА - графитовых электродах - немодифицированных и - - модифицированных лакказами 2 - - базидиомицетов.
- - T. hirsuta T. ochreacea - - -50 150 350 550 750 950 -50 150 350 550 750 950 Условия:
Е, мВ (отн. NHE) Е, мВ (отн. NHE) 0,1 М цитратно-фосфатный буфер, рН 3,0;
скорость развертки потенциала – 1 1 0 мВ/сек;
стартовый потенциал – 1100 мВ.
Ток, мкА Ток, мкА -5 -.
- - - - - C. fulvocinerea C.maxima - - - -50 150 350 550 750 950 -50 150 350 550 750 950 Е, мВ (отн. NHE) Е, мВ (отн. NHE) Необходимо отметить, что для C. fulvocinerea Lc наблюдалась более низкая электрокаталитическая активность по сравнению с другими изученными ферментами базидиомицетов, в то время как ее активность в гомогенном растворе сравнима с активностью других Lc. Возможно, это объясняется высоким (32%) содержанием углеводов в C. fulvocinerea Lc (Таблица 1), что может оказывать влияние на ориентацию молекул фермента на поверхности электрода, а также затруднять ЭП с электрода на Т1 центр фермента.
Как видно из рисунка 31, начало электровосстановления O2 на электродах, модифицированных Lc, находится в области 800 мВ, т.е. существует корреляция между потенциалом Т1 центра ферментов и началом реакции электровосстановления O2 на электроде.
Такая же корреляция получена и для низко редокс-потенциальных растительной Lc и бактериальной MCO. При этом оптимум рН биокаталитической реакции восстановления O находится в сильно кислой области для Lc базидиомицетов и слабощелочной области для растительного и бактериального ферментов, что совпадает с оптимумами рН гомогенных реакций данных биокатализаторов.
Lc аскомицетов, например, дикого типа L. wrigthii и рекомбинантная M. thermophila, не катализировали ускорение реакции электровосстановления О2. При этом, на циклических вольтамперограммах ферментов регистрировались достаточно ярко выраженные редокс процессы в области потенциалов 400 мВ отн. NHE.
Электрохимическое изучение Cp проводилось на модифицированных и немодифицированных электродах из спектрального графита. В качестве примера, на Рис. представлены циклические вольтамперограммы электродов из спектрального графита с иммобилизованной смесью многостенных углеродных нанотрубок с Cp. На электродах из спектрального графита, модифицированных и немодифицированных многостенными и одностенными нанотрубками, всегда присутствовал фарадеевский процесс со значением потенциала средней точки около 380 мВ отн. NHE. Поверхностная концентрация фермента, рассчитанная с учетом одноэлектронного переноса, достигала 8 и 14 пмоль/см2 для катодного и анодного пика, соответственно, с учетом факторов шероховатости элетродов.
Наряду с квазиобратимым процессом, наблюдался катодный пик со значением потенциала около 580 мВ и рассчитанной поверхностной концентрацией Cp около 3 пмоль/см2.
Использование многостенных карбоновых нанотрубок в качестве матрицы для иммобилизации фермента приводило к обнаружению высоко редокс-потенциального квазиобратимого процесса со значением потенциала средней точки около 690 мВ отн. NHE. Показана чувствительность обоих редокс-процессов к О2, а именно исчезновение редокс-активности Cp в анаэробных условиях (Рис. 32). Однако, как и при использовании золотых электродов, ускорения реакции электровосстановления О2 адсорбированным Cp не наблюдалось.
8.0 1. 6.0 0. А Б air 0. N 4. 0. 2. Ток, мкА Ток, мкА 0. bare nanotubes нанотрубки ceruloplasmin,воздух церулоплазмин, air 0. I (A) I (A) 0. ceruloplasmin,N2 церулоплазмин, N -2.0 -0. -0. -4. -0. -6. -0. -8.0 -1. 0 100 200 300 400 500 600 700 800 900 1000 100 200 300 400 500 600 700 800 Е, мВ EЕ, мВ E (mV) (mV) Рисунок 32. Циклические вольтамперограммы электродов из спектрального графита, модифицированных многостеночными карбоновыми нанотрубками с адсорбированным церулоплазмином (скорость развертки потенциала – 100 мВ/сек;
стартовый потенциал – 1000 мВ) А – исходные вольтамперные сигналы, Б – кривые за вычетом фона.