авторефераты диссертаций БЕСПЛАТНАЯ  БИБЛИОТЕКА

АВТОРЕФЕРАТЫ КАНДИДАТСКИХ, ДОКТОРСКИХ ДИССЕРТАЦИЙ

<< ГЛАВНАЯ
АГРОИНЖЕНЕРИЯ
АСТРОНОМИЯ
БЕЗОПАСНОСТЬ
БИОЛОГИЯ
ЗЕМЛЯ
ИНФОРМАТИКА
ИСКУССТВОВЕДЕНИЕ
ИСТОРИЯ
КУЛЬТУРОЛОГИЯ
МАШИНОСТРОЕНИЕ
МЕДИЦИНА
МЕТАЛЛУРГИЯ
МЕХАНИКА
ПЕДАГОГИКА
ПОЛИТИКА
ПРИБОРОСТРОЕНИЕ
ПРОДОВОЛЬСТВИЕ
ПСИХОЛОГИЯ
РАДИОТЕХНИКА
СЕЛЬСКОЕ ХОЗЯЙСТВО
СОЦИОЛОГИЯ
СТРОИТЕЛЬСТВО
ТЕХНИЧЕСКИЕ НАУКИ
ТРАНСПОРТ
ФАРМАЦЕВТИКА
ФИЗИКА
ФИЗИОЛОГИЯ
ФИЛОЛОГИЯ
ФИЛОСОФИЯ
ХИМИЯ
ЭКОНОМИКА
ЭЛЕКТРОТЕХНИКА
ЭНЕРГЕТИКА
ЮРИСПРУДЕНЦИЯ
ЯЗЫКОЗНАНИЕ
РАЗНОЕ
КОНТАКТЫ


Pages:     | 1 ||

Роль структуры поверхностных белков оболочечных вирусов в формировании вирионов

-- [ Страница 2 ] --

ВЫВОДЫ Предложен новый подход изучения структурных свойств надмолекулярного 1.

комплекса линкерных последовательностей - «ножки» «шипа» гемагглютинина вируса гриппа. Выявлены тип/субтип-специфичные особенности ее архитектуры.

Разработана методология исследования упаковки трансмембранных доменов 2.

поверхностных белков в составе природных олигомеров. Впервые обнаружены принципиальные различия гомотримерной ассоциации трансмембранных доменов у гемагглютининов, принадлежащих к эволюционной Группе-1 (Н1-Группа) и Группе- (Н3-Группа) вируса гриппа А.

Сформулирована концепция о дифференциальном S-ацилировании остатками 3.

пальмитата и стеарата поверхностных белков оболочечных вирусов. Стеарат локализован исключительно на остатке цистеина, расположенном на границе трансмембранного и цитоплазматического доменов, в то время как сайты в цитоплазматическом домене модифицированы пальмитатами.

Разработана биотехнологическая платформа для типирования и 4.

субтипирования гемагглютинина, основанная на выявленных закономерностях характера S-ацилирования у более чем 40 исследованных штаммов вируса.

Предложен ряд экспериментальных моделей для изучения структурной и 5.

биологической значимости вирусных белков. С помощью S-ацилирования разработанных моделей показано, что гидрофобная модификация, имитирующая S ацилирование, не меняет вторичную структуру С-концевого сегмента гемагглютинина в липидном бислое. Другие вирусные белки (включая нейраминидазу, белки М1 и М2) не влияют на S-стеарилирование гемагглютинина в процессе морфогенеза вирионов.

На основании экспериментальных данных и результатов компьютерного 6.

моделирования выдвинута гипотеза о том, что остатки жирных кислот могут стабилизировать гомотримерную структуру трансмембранных доменов гемагглютинина вируса гриппа в мембранном окружении и участвовать в тонкой регуляции пространственной упаковки комплекса.

СПИСОК ОСНОВНЫХ РАБОТ, ОПУБЛИКОВАННЫХ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ Статьи в рецензируемых научных журналах, рекомендованных ВАК РФ:

1 Mineev K.S., Lyukmanova E.N., Krabben L., Serebryakova M.V., Shulepko M.A., Arseniev A.S., Kordyukova L.V., Veit M. Structural investigation of Influenza virus hemagglutinin membrane-anchoring peptide // Protein Engineering, Design, and Selection. 2013. V. 26. P. 547-552.

2 Veit M., Serebryakova M.V., Kordyukova L.V. Palmitoylation of influenza virus proteins // Biochemical Society Transactions. 2013. V. 41. P. 50-55.

3 Serebryakova M.V., Kordyukova L.V., Rudneva I.A., Kropotkina E.A., Veit M., Baratova L.A. Mass spectrometry analysis of influenza virus reassortant clones does not reveal an influence of other viral proteins on S-acylation of hemagglutinin // Archives of Virology. 2013. V. 158. P. 467-472.

Кордюкова Л.В., Серебрякова Л.В. Масс-спектрометрические подходы в изучении оболочечных вирусов: новые возможности для структурной биологии и профилактической медицины // Биохимия. 2012. Т. 77. № 8. С. 1002-1016.

5 Serebryakova M.V., Kordyukova L.V., Semashko T.A., Ksenofontov A.L., Rudneva I.A., Kropotkina E.A., Filippova I.Y., Veit M., Baratova L.A. Influenza virus hemagglutinin spike neck architectures and interaction with model enzymes evaluated by MALDI-TOF mass spectrometry and bioinformatics tools // Virus Research. 2011. V.

160. P. 294-304.

6 Kordyukova L.V., Serebryakova M.V., Polyansky A.A., Kropotkina E.A., Alexeevski A.V., Veit M., Efremov R.G., Filippova I.Y., Baratova L.A. Linker and/or transmembrane regions of influenza A/Group-1, A/Group-2, and type B virus hemagglutinins are packed differently within trimers // Biochimica et Biophysica Acta.

201. V. 1808. P. 1843-1854.

7 Kordyukova L.V., Serebryakova M.V., Baratova L.A., Veit M. Site-specific attachment of palmitate or stearate to cytoplasmic versus transmembrane cysteines is a common feature of viral spike proteins // Virology. 2010. V. 398. P. 49-56.

8 Shishkov A.V., Bogacheva E.N., Dolgov A.A., Chulichkov A.L., Knyazev D.G., Fedorova N.V., Ksenofontov A.L., Kordyukova L.V., Lukashina E.V., Mirsky V.M., Baratova L.A. The in situ structural characterization of the influenza A virus matrix M protein within a virion // Protein and Peptide Letters. 2009. V. 16. P. 1407-1413.

9 Smirnova Y.A., Fedorova N.V., Ksenofontov A.L., Kordyukova L.V., Serebryakova M.V., Baratova L.A., Vaskovsky B.V. Isolation of the influenza A HA2 C-terminal segment by combination of nonionic detergents // Advances in Experimental Medicine and Biology. 2009. V. 611. P. 311-312.

10 Kordyukova L.V., Serebryakova M.V., Polyakov V.Y., Ovchinnikova T.V., Smirnova Y.A., Fedorova N.V., Baratova L.A. Influenza A virus M1 protein structure probed by in situ limited proteolysis with bromelain // Protein and Peptide Letters. 2008. V. 15. P.

922-930.

11 Kordyukova L.V., Serebryakova M.V., Baratova L.A., Veit M. S acylation of the hemagglutinin of influenza viruses: mass spectrometry reveals site-specific attachment of stearic acid to a transmembrane cysteine // Journal of Virology. 2008. V. 82. P.

9288-9292.

Смирнова Ю.А., Кордюкова Л.В., Серебрякова М.В., Филиппова И.Ю., Лысогорская Е.Н, Баратова Л.А. Вирион вируса гриппа как субстрат протеолитических ферментов // Биоорганическая химия. 2008. Т. 34. № 3. С. 409 415.

Ксенофонтов А.Л., Бадун Г.А., Федорова Н.В., Кордюкова Л.В. Количественное определение площади гликобелков на поверхности оболочечных вирусов // Молекулярная биология. 2008. Т. 42. № 6. С. 1093-1096.



14 Serebryakova M.V., Kordyukova L.V., Baratova L.A., Markushin S.G. Mass spectrometric sequencing and acylation character analysis of C-terminal anchoring segment from Influenza A hemagglutinin // European Journal of Mass Spectrometry.

2006. V. 12. P. 51-62.

Ксенофонтов А.Л., Козловский В.С., Кордюкова Л.В., Радюхин М, Тимофеева А.В., Добров Е.Н. Определение концентрации и размера агрегатов в препаратах вируса гриппа по спектрам истинного поглощения в УФ-свете. // Молекулярная биология. 2006. Т. 40. № 1. С. 172-179.

16 Kordyukova L.V., Ksenofontov A.L., Serebryakova M.V., Ovchinnikova T.V., Fedorova N.V., Ivanova V.T., Baratova L.A. Influenza A hemagglutinin C-terminal anchoring peptide: identification and mass spectrometric study // Protein and Peptide Letters.

2004. V. 11. P. 385-391.

Иванова В.Т., Кордюкова Л.В., Маныкин А.А., Бурцева Е.И., Загорская Ю.В., Оскерко Т.А., Слепушкин А.Н.. Особенности протеолитической обработки современных вирусов гриппа А и В. Получение субвирусных частиц с использованием фермента бромелаина // Вопросы вирусологии. 2003. Т. 48. № 5.

С. 14-18.

Материалы конференций:

18 Kordyukova L.V., Serebryakova M.V., Kropotkina E.A., Veit M. Lipidation of viral proteins studied with MALDI-TOF MS // Federation of American Societies for Experimental Biology (FASEB) Science Research Conference «Protein Lipidation, Signaling, and Membrane Domains». Saxtons River (VT, USA). 2013. P2.

Кордюкова Л.В., Серебрякова М.В., Кропоткина Е.А., Veit M., Полянский А.А.

Изучение пост-трансляционной модификации (S-ацилирования) вирусных белков методом МАЛДИ-МС // Тезисы Международной научно-практической III конференции «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине (Postgenome 2012)». Казань (Россия). 2012. С. 146-147.

20 Serebryakova M.V., Rudneva I.A., Kropotkina E.A., Veit M., Kordyukova L.V. MALDI TOF MS: a new approach to study S-acylation of viral proteins // Abstracts of A Biochemical Society Focused Meeting «Regulation of protein trafficking and function by palmitoylation». Oxford (UK). 2012. P. 14. P011.

21 Brett K., Kordyukova L., Moeller L., Laue M., Veit M. Mutations in the cytoplasmic tail of HA in Influenza virus – with focus on S-Acylation // 3rd International Influenza Meeting. Muenster (Germany). 2012. P. 155. P110.

Кордюкова Л.В., Серебрякова М.В., Полянский А.А., Veit M. Структурные исследования трансмембранных гликопротеинов оболочечных вирусов с использованием методов протеолиза, масс-спектрометрии и MALDI-TOF молекулярного моделирования // Тезисы V Российского симпозиума «Белки и пептиды». Петрозаводск (Россия). 2011. С. 86.

23 Kordyukova L.V. Phylogeny of influenza hemagglutinin transmembrane domains:

evaluation with enzyme proteolysis, mass spectrometry and bioinformatics tools // Young Scientist Workshop «Methods to study influenza virus». Berlin (Germany).

2011. P. 27-28.

24 Kordyukova L.V., Serebryakova M.V., Veit M. Differential S-acylation with palmitate or stearate is a common feature of viral glycoproteins // Abstracts of the 19 Annual Meeting of the Society of Virology (GfV). Liepzig (Germany). 2009. P. 628. VMIT P8.

Кордюкова Л.В., Серебрякова М.В., Veit M., Смирнова Ю.А., Кропоткина Е.А., Баратова Л.А. Использование MALDI-TOF масс-спектрометрии для изучения ацилирования гемагглютинина вируса гриппа // Тезисы IV съезда Российского общества биохимиков и молекулярных биологов. Новосибирск (Россия). 2008. C.

459.

26 Kordyukova L., Serebryakova M., Smirnova Yu., Veit M. Acylation of Influenza Virus Hemagglutinin analyzed by MALDI-TOF MS //

Abstract

of the 3rd European Virology Congress. Nuremberg (Germany). 2007. P. 47. SAS008.

27 Smirnova Ju.A., Kordyukova L.V., Fedorova N.V., Baratova L.A., Serebryakova M.V., Veit М. Influenza virus membrane proteome structural investigation based on enzyme proteolysis and MALDI-TOF mass spectrometry // Proceedings of the 3rd Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB’07). Moscow (Russia).

2007. P. 277-278.

28 Kordyukova L.V., Serebryakova M.V., Smirnova Y.A., Ovchinnikova T.V., Lysogorskaya E.N., Filippova I.Y., Baratova L.A. Influenza A virus particles as a substrate for bromelain // Journal of Peptide Science. 2006. V. 12 (S1). P. 168. Th255.

29 Kordyukova L.V., Serebryakova M.V., Smirnova Y.A., Fedorova N.V., Timofeeva A.V., Ivanova V.T., Markushin S.G., Baratova L.A. Influenza virus membrane proteins:

studying by proteomic tools // Abstracts of the 9th Chinese International Peptide Symposium. 2006. Shanghai (China). P. 45-46.

30 Kordyukova L.V., Serebryakova M.V., Ovchinnikova T.V., Ivanova V.T., Baratova L.A.

Influenza A hemagglutinin C-terminal anchoring peptide. MS identification and approach to structural study // Peptides-2004. Proceedings of the 3rd International and 28th European Peptide Symposium, eds.: M. Flegel, M. Fridkin, C. Gilon and J.

Slaninova. Kenes International, Tel-Aviv, Israel. 2005. P. 435-436.

31 Kordyukova L.V., Ksenofontov A.L., Serebryakova M.V., Ovchinnikova T.V., Fedorova N.V., Ivanova V.T., Baratova L.A. Influenza A hemagglutinin C-terminal anchoring peptide. MS identification and approach to structural study // Journal of Peptide Science. 2004. V. 10 (8). P. 165. P174.

Кордюкова Л.В., Серебрякова М.В., Овчинникова Т.В., Радюхин В.А. Протеомные исследования заякоренного в мембране С-концевого участка гемагглютинина вируса гриппа // Тезисы докладов и стендовых сообщений VII чтений, посвященных памяти академика Ю.А. Овчинникова. Москва. 2004. С. 46-47.

Кордюкова Л.В., Ксенофонтов А.Л., Федорова Н.В., Серебрякова М.В., Овчинникова Т.В., Баратова Л.А. Выделение и структурные исследования С концевого фрагмента гемагглютинина вируса гриппа А // Российский симпозиум по химии и биологии пептидов. Москва (Россия). 2003. C. 28.

34 Kordyukova L.V., Ksenofontov A.L., Fedorova N.V., Baratova L.A. Influenza A hemagglutinin C-terminal peptide: An attempt for isolation and characterization // 3rd International Symposium on Separations in BioSciencies SBS’03 «100 Years of Chromatography». Moscow (Russia). 2003. P. 135.



Pages:     | 1 ||
 

Похожие работы:


 
2013 www.netess.ru - «Бесплатная библиотека авторефератов кандидатских и докторских диссертаций»

Материалы этого сайта размещены для ознакомления, все права принадлежат их авторам.
Если Вы не согласны с тем, что Ваш материал размещён на этом сайте, пожалуйста, напишите нам, мы в течении 1-2 рабочих дней удалим его.